MARQUES, Sérgio Manuel, Lucie ŠUPOLÍKOVÁ, Lenka MOLČANOVÁ, Karel ŠMEJKAL, David BEDNÁŘ a Iva SLANINOVÁ. Screening of Natural Compounds as P-Glycoprotein Inhibitors against Multidrug Resistance. BIOMEDICINES. BASEL: MDPI, roč. 9, č. 4, s. 1-22. ISSN 2227-9059. doi:10.3390/biomedicines9040357. 2021.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Screening of Natural Compounds as P-Glycoprotein Inhibitors against Multidrug Resistance
Autoři MARQUES, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí), Lucie ŠUPOLÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka MOLČANOVÁ (703 Slovensko, domácí), Karel ŠMEJKAL (203 Česká republika, domácí), David BEDNÁŘ (203 Česká republika, domácí) a Iva SLANINOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání BIOMEDICINES, BASEL, MDPI, 2021, 2227-9059.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30104 Pharmacology and pharmacy
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.757
Kód RIV RIV/00216224:14110/21:00121577
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3390/biomedicines9040357
UT WoS 000642790800001
Klíčová slova anglicky flavonoids; molecular dynamics; molecular docking; multidrug resistance; natural compounds; P-glycoprotein; structure-based virtual screening
Štítky 14110513, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:15.
Anotace
Multidrug resistance (MDR) is a common problem when fighting cancer with chemotherapy. P-glycoprotein (P-gp, or MDR1) is an active pump responsible for the efflux of xenobiotics out of the cell, including anti-cancer drugs. It is a validated target against MDR. No crystal structure of the human P-gp is available to date, and only recently several cryo-EM structures have been solved. In this paper, we present a comprehensive computational approach that includes constructing the full-length three-dimensional structure of the human P-gp and its refinement using molecular dynamics. We assessed its flexibility and conformational diversity, compiling a dynamical ensemble that was used to dock a set of lignan compounds, previously reported as active P-gp inhibitors, and disclose their binding modes. Based on the statistical analysis of the docking results, we selected a system for performing the structure-based virtual screening of new potential P-gp inhibitors. We tested the method on a library of 87 natural flavonoids described in the literature, and 10 of those were experimentally assayed. The results reproduced the theoretical predictions only partially due to various possible factors. However, at least two of the predicted natural flavonoids were demonstrated to be effective P-gp inhibitors. They were able to increase the accumulation of doxorubicin inside the human promyelocytic leukemia HL60/MDR cells overexpressing P-gp and potentiate the antiproliferative activity of this anti-cancer drug.
Návaznosti
LM2018121, projekt VaVNázev: Výzkumná infrastruktura RECETOX (Akronym: RECETOX RI)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, RECETOX RI
LM2018131, projekt VaVNázev: Česká národní infrastruktura pro biologická data (Akronym: ELIXIR-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Česká národní infrastruktura pro biologická data
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
MUNI/A/1325/2020, interní kód MUNázev: Biomedicínské vědy
Investor: Masarykova univerzita, Biomedicínské vědy
814418, interní kód MUNázev: Synthetic biology-guided engineering of Pseudomonas putida for biofluorination (Akronym: SinFonia)
Investor: Evropská unie, Synthetic biology-guided engineering of Pseudomonas putida for biofluorination, Leadership in enabling and industrial technologies (LEIT) (Industrial Leadership)
VytisknoutZobrazeno: 28. 3. 2024 10:20