Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

SMITALOVÁ, Dagmar, D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays. Practical Laboratory Medicine. AMSTERDAM: ELSEVIER, roč. 25, MAY, s. nestrankovano, 6 s. ISSN 2352-5517. doi:10.1016/j.plabm.2021.e00210. 2021.

Základní údaje

• Originální název: Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays
• Autoři: SMITALOVÁ, Dagmar (203 Česká republika, domácí), D. DVORAKOVA, Zdeněk RÁČIL (203 Česká republika) a Marianna ROMŽOVÁ (703 Slovensko, domácí).
• Vydání: Practical Laboratory Medicine, AMSTERDAM, ELSEVIER, 2021, 2352-5517.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 30204 Oncology
• Stát vydavatele: Nizozemské království
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/21:00120108
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210
• UT WoS: 000653682600011
• Klíčová slova anglicky: Chronic myeloid leukemia; BCR-ABL1 monitoring; GeneXpert BCR-ABL Monitor assay; RT-qPCR; Digital PCR
• Štítky: 14110212, podil, rivok
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.

Návaznosti

• MUNI/A/1105/2018, interní kód MU: Název: Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI (Akronym: VýDiTeHeMA VI)

Investor: Masarykova univerzita, Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

• MUNI/A/1395/2019, interní kód MU: Název: Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VII (Akronym: VýDiTeHeMa VII)

Investor: Masarykova univerzita, Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VII, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

• NV17-30397A, projekt VaV: Název: Mutační analýza primitivních buněčných populací u chronické myeloidní leukémie: za hranicí BCR-ABL1