STŘELÁK, David, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, José VILAS, Erney RAMÍREZ-APORTELA, Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA, David MALUENDA, Javier VARGAS, David HERREROS, Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ, Federico DE ISIDRO-GÓMEZ, Jan HORÁČEK, David MYŠKA, Martin HORÁČEK, Pablo CONESA, Yunior FONSECA-REYNA, Jorge JIMÉNEZ, Marta MARTÍNEZ, Mohamad HARASTANI, Slavica JONIĆ, Jiří FILIPOVIČ, Roberto MARABINI, José CARAZO a Carlos SORZANO. Advances in Xmipp for Cryo–Electron Microscopy: From Xmipp to Scipion. Molecules. Mayer und Muller, 2021, roč. 26, č. 20, s. 1-14. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules26206224.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Advances in Xmipp for Cryo–Electron Microscopy: From Xmipp to Scipion
Autoři STŘELÁK, David (203 Česká republika, garant, domácí), Amaya JIMÉNEZ-MORENO (724 Španělsko), José VILAS (724 Španělsko), Erney RAMÍREZ-APORTELA (724 Španělsko), Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA (724 Španělsko), David MALUENDA (724 Španělsko), Javier VARGAS (724 Španělsko), David HERREROS (724 Španělsko), Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ (724 Španělsko), Federico DE ISIDRO-GÓMEZ (724 Španělsko), Jan HORÁČEK (203 Česká republika, domácí), David MYŠKA (203 Česká republika, domácí), Martin HORÁČEK (203 Česká republika, domácí), Pablo CONESA (724 Španělsko), Yunior FONSECA-REYNA (724 Španělsko), Jorge JIMÉNEZ, Marta MARTÍNEZ (724 Španělsko), Mohamad HARASTANI (250 Francie), Slavica JONIĆ (250 Francie), Jiří FILIPOVIČ (203 Česká republika, domácí), Roberto MARABINI (724 Španělsko), José CARAZO (724 Španělsko) a Carlos SORZANO (724 Španělsko).
Vydání Molecules, Mayer und Muller, 2021, 1420-3049.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.927
Kód RIV RIV/00216224:14330/21:00122593
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.3390/molecules26206224
UT WoS 000714566400001
Klíčová slova anglicky Xmipp; Cryo-EM; Scipion; single-particle analysis
Štítky J-Q2
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. David Střelák, Ph.D., učo 373911. Změněno: 24. 1. 2022 18:04.
Anotace
Xmipp is an open-source software package consisting of multiple programs for processing data originating from electron microscopy and electron tomography, designed and managed by the Biocomputing Unit of the Spanish National Center for Biotechnology, although with contributions from many other developers over the world. During its 25 years of existence, Xmipp underwent multiple changes and updates. While there were many publications related to new programs and functionality added to Xmipp, there is no single publication on the Xmipp as a package since 2013. In this article, we give an overview of the changes and new work since 2013, describe technologies and techniques used during the development, and take a peek at the future of the package.
Návaznosti
EF16_013/0001802, projekt VaVNázev: CERIT Scientific Cloud
MUNI/A/1411/2019, interní kód MUNázev: Aplikovaný výzkum: softwarové architektury kritických infrastruktur, bezpečnost počítačových systémů, zpracování přirozeného jazyka a jazykové inženýrství, vizualizaci velkých dat a rozšířená realita.
Investor: Masarykova univerzita, Aplikovaný výzkum: softwarové architektury kritických infrastruktur, bezpečnost počítačových systémů, zpracování přirozeného jazyka a jazykové inženýrství, vizualizaci velkých dat a rozšířená realita., DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1549/2020, interní kód MUNázev: Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity 21 (Akronym: SKOMU)
Investor: Masarykova univerzita, Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity 21
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 19:21