R 2022

Caver Web 1.2

MUSIL, Miloš, Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ, Jan ŠTOURAČ, Jakub GALGONEK et. al.

Basic information

Original name

Caver Web 1.2

Name (in English)

Caver Web 1.2

Authors

MUSIL, Miloš (203 Czech Republic, belonging to the institution), Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan ŠTOURAČ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jakub GALGONEK, jiří VONDÁŠEK, David BEDNÁŘ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Jiří DAMBORSKÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

2022

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Software

Field of Study

10608 Biochemistry and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

obsah podléhá obchodnímu tajemství

References:

RIV identification code

RIV/00216224:14310/22:00127433

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

Web serverů; proteins; ligand transport; tunnels and channels in proteins; virtuální skríning

Technical parameters

V budoucnu je plánována nabídka potencionálním partnerům.
Změněno: 13/12/2022 13:53, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Abstract

ORIG EN

V originále

*Caver Web 1.2 je nová verze webového serveru, která spojuje možnost stanovení proteinových tunelů s výpočtem trajektorie ligandů. Nová verze serveru CaverWeb byla rozšířena o možnost využít nové ligandy z Integrované databáze malých molekul (IDSM) a o zcela zautomatizovaný virtuální skríning umožňující rychlé vyhodnocení předdefinovaného setu více jak 4300 léčiv schválených FDA.

In English

*CaverWeb 1.2 is a new version of the web server combining the capabilities for the detection of protein tunnels with the calculation of the ligand trajectories. The new version of the CaverWeb server was expanded with the ability to fetch novel ligands from the Integrated Database of Small Molecules (IDSM) and with the fully automated virtual screening pipeline allowing for the fast evaluation of the predefined set of over 4,300 FDA-approved drugs.

Links

LX22NPO5102, research and development project
Name: Národní ústav pro výzkum rakoviny (Acronym: NÚVR)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, National institute for cancer research, 5.1 EXCELES