Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{2242912,
author = {Večeřa, Marek and Radová, Lenka and Siegl, František and Smrčka, Martin and Jančálek, Radim and Hermanová, Markéta and Hendrych, Michal and Křen, Leoš and Šána, Jiří and Slabý, Ondřej},
article_location = {Praha},
article_number = {Supplementum 1},
doi = {http://dx.doi.org/10.48095/ccko20221S107},
keywords = {brain neoplasms; neoplasm metastasis; microRNAs; next-generation sequencing; biomarkers},
language = {cze},
issn = {0862-495X},
journal = {Klinická onkologie},
title = {Sekvenování mikroRNA v mozkových metastázách jako nový diagnostický nástroj},
url = {https://www.linkos.cz/casopis-klinicka-onkologie/2022-10-12-supplementum-1/sekvenovani-mikrorna-v-mozkovych-metastazach-jako-novy-dia-gnosticky-nastroj/},
volume = {35},
year = {2022}
}
TY - JOUR
ID - 2242912
AU - Večeřa, Marek - Radová, Lenka - Siegl, František - Smrčka, Martin - Jančálek, Radim - Hermanová, Markéta - Hendrych, Michal - Křen, Leoš - Šána, Jiří - Slabý, Ondřej
PY - 2022
TI - Sekvenování mikroRNA v mozkových metastázách jako nový diagnostický nástroj
JF - Klinická onkologie
VL - 35
IS - Supplementum 1
SP - 107-109
EP - 107-109
PB - Česká lékařská společnost J. E. Purkyně
SN - 0862495X
KW - brain neoplasms
KW - neoplasm metastasis
KW - microRNAs
KW - next-generation sequencing
KW - biomarkers
UR - https://www.linkos.cz/casopis-klinicka-onkologie/2022-10-12-supplementum-1/sekvenovani-mikrorna-v-mozkovych-metastazach-jako-novy-dia-gnosticky-nastroj/
N2 - Východiska: Mozkové metastázy (BM) jsou nejčastějšími intrakraniálními nádory u dospělých onkologických pacientů. Zatímco dříve byly BM léčeny pouze symptomaticky, přístup k terapii se mění v důsledku zvyšující se incidence, vyplývající z efektivnější léčby primárních nádorů a časnějšího záchytu malých asymptomatických BM. Protože prognóza pacientů s BM je vysoce variabilní, bylo by užitečné zlepšit diagnostické a prognostické nástroje začleněním nových výkonných biomarkerů. MikroRNA (miRNA) jsou v tomto ohledu slibné a díky své vysoké stabilitě vhodné jak pro sekvenování (RNA-Seq), tak pro retrospektivní analýzy v tkáních fixovaných formalinem a zalitých v parafinu (formalin-fixed and paraffin embedded – FFPE). Materiál a metody: Celková RNA obohacená o miRNA byla izolována ze 71 čerstvě zmrazených histopatologicky potvrzených tkání BM s původem v pěti typech nádorů (karcinom plic, 37 %; melanom, 23 %; karcinom prsu, 18 %; renální karcinom, 15 %; kolorektální karcinom, 7 %). Před léčbou byl od každého pacienta získán informovaný souhlas schválený místní etickou komisí. Z RNA byly připraveny knihovny pro sekvenování na platformě NextSeq 500 (Illumina). Mapování čtení na referenci bylo provedeno pomocí nástroje miraligner a databáze miRBase a diferenciální analýza pro 2 437 maturovaných miRNA pomocí nástroje limma. Molekuly miRNA ze vzorků celkové RNA izolovaných z retrospektivního souboru 119 FFPE tkání byly reverzně transkribovány a exprese vybraných diferenciálně exprimovaných miRNA (miR-122-5p, miR-141-3p, miR-146a-5p, miR-194-5p, miR-200c-3p, miR-211-3p, miR-215-5p, miR-514b-3p, miR-934, miR-1270) byla validována pomocí qPCR. Výsledky: Diferenciální analýzou bylo identifikováno 373 miRNA s významně odlišnou expresí mezi pěti skupinami BM (p < 0,001). Následnou validací byla ověřena významně odlišná exprese vybraných miRNA v pěti skupinách BM. Závěr: Prezentované výsledky potvrzují důležitost studia dysregulované exprese miRNA v BM a diagnostický potenciál validovaných miRNA.
ER -
VEČEŘA, Marek, Lenka RADOVÁ, František SIEGL, Martin SMRČKA, Radim JANČÁLEK, Markéta HERMANOVÁ, Michal HENDRYCH, Leoš KŘEN, Jiří ŠÁNA and Ondřej SLABÝ. Sekvenování mikroRNA v mozkových metastázách jako nový diagnostický nástroj (Sequencing of microRNAs in brain metastases as a new diagnostic tool). \textit{Klinická onkologie}. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, vol.~35, Supplementum 1, p.~107-109. ISSN~0862-495X. Available from: https://dx.doi.org/10.48095/ccko20221S107.
|
