Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{2247585, author = {Hlucháňová, Lucie and Gelbíčová, Tereza and Karpíšková, Renata}, article_location = {CZECH REPUBLIC}, article_number = {2}, keywords = {Listeria monocytogenes; whole genome sequencing; listeriosis; serotyping; virulence}, language = {cze}, issn = {1210-7913}, journal = {EPIDEMIOLOGIE MIKROBIOLOGIE IMUNOLOGIE}, title = {Genetická rozmanitost humánních kmenů Listeria monocytogenes v České republice v letech 2016-2019}, url = {https://www.prolekare.cz/en/journals/epidemiology-microbiology-immunology/2022-2-24/genetic-diversity-of-human-strains-of-listeria-monocytogenes-in-the-czech-republic-in-2016-2020-131398?hl=cs}, volume = {71}, year = {2022} }
TY - JOUR ID - 2247585 AU - Hlucháňová, Lucie - Gelbíčová, Tereza - Karpíšková, Renata PY - 2022 TI - Genetická rozmanitost humánních kmenů Listeria monocytogenes v České republice v letech 2016-2019 JF - EPIDEMIOLOGIE MIKROBIOLOGIE IMUNOLOGIE VL - 71 IS - 2 SP - 102-108 EP - 102-108 PB - CESKA LEKARSKA SPOLECNOST J EV PURKYNE SN - 12107913 KW - Listeria monocytogenes KW - whole genome sequencing KW - listeriosis KW - serotyping KW - virulence UR - https://www.prolekare.cz/en/journals/epidemiology-microbiology-immunology/2022-2-24/genetic-diversity-of-human-strains-of-listeria-monocytogenes-in-the-czech-republic-in-2016-2020-131398?hl=cs N2 - Cíl práce: Cílem studie bylo určit genetickou rozmanitost humánních izolátů získaných v letech 2016–2020 z klinických laboratoří z různých lokalit České republiky (ČR) s ohledem na možné epidemické souvislosti a virulenci Listeria monocytogenes za využití dat celogenomového sekvenování. Metody: Ve studii byl použit soubor 102 humánních izolátů L. monocytogenes, u kterých byl určen sérotyp sklíčkovou aglutinací v kombinaci s multiplex PCR sérotypizací. Retrospektivně bylo provedeno celogenomové sekvenování a na základě získaných dat byla posouzena klonální příbuznost testovaných kmenů a přítomnost genů virulence pomocí softwaru Ridom SeqSphere+. Výsledky: V období let 2016–2020 bylo celkem charakterizováno 102 humánních izolátů L. monocytogenes, což činí 65 % ze všech hlášených případů listerióz registrovaných ve sledovaném období v ČR v systémech ISIN/EPIDAT. Dominantní zastoupení měl sérotyp 1/2a (57 %), následoval sérotyp 4b (30 %) a jen ojediněle byly detekovány kmeny sérotypu 1/2b (12 %) a 1/2c (1 %). Na základě analýzy celogenomových dat byly kmeny zařazeny k 26 klonálním komplexům a 27 sekvenačním typům. Porovnáním cgMLST (core genome Multi-Locus Sequence Typing) byly detekovány čtyři klastry o více jak třech kmenech vykazující vysokou příbuznost (rozdíly do 10 alel) s možnou epidemickou souvislostí. U všech kmenů byla potvrzena přítomnost klíčových genů virulence. Pouze u tří kmenů (sérotypu 1/2a, 1/2b a 1/2c) byla detekována bodová mutace v genu inlA spojovaná s expresí zkráceného proteinu internalinu A, který je zapojený do mechanismu přestupu L. monocytogenes intestinální bariérou. Závěr: Molekulární epidemiologie založená na celogenomovém sekvenování představuje účinný nástroj ke studiu populační struktury kmenů L. monocytogenes. V této studii byla zjištěna vysoká heterogenita humánních kmenů L. monocytogenes, zejména u v České republice dominantního sérotypu 1/2a. Bylo identifikováno několik klastrů s možnou epidemickou souvislostí, jejichž výskyt bude dále sledován. ER -
HLUCHÁŇOVÁ, Lucie, Tereza GELBÍČOVÁ and Renata KARPÍŠKOVÁ. Genetická rozmanitost humánních kmenů Listeria monocytogenes v České republice v letech 2016-2019 (Genetic diversity of human strains of Listeria monocytogenes in the Czech Republic in 2016-2020). \textit{EPIDEMIOLOGIE MIKROBIOLOGIE IMUNOLOGIE}. CZECH REPUBLIC: CESKA LEKARSKA SPOLECNOST J EV PURKYNE, 2022, vol.~71, No~2, p.~102-108. ISSN~1210-7913.
|