Detailed Information on Publication Record
2023
Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie
GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA et. al.Basic information
Original name
Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie
Name (in English)
Oral bacterioma in patients with squamous cell carcinoma based on their gingival status: a pilot study
Authors
GACHOVÁ, Daniela (203 Czech Republic), Zdeněk DANĚK (203 Czech Republic), Ctirad MACHÁČEK (203 Czech Republic), Soňa SMETANOVÁ (203 Czech Republic), Petr ANDRLA (203 Czech Republic), Eva BUDINSKÁ (703 Slovakia) and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)
Edition
ONCO Prague, 2023, 2023
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
10608 Biochemistry and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14110/23:00130315
Organization unit
Faculty of Medicine
Keywords in English
bacterioma; squamous cell carcinoma; pilot study
Změněno: 30/3/2023 13:56, Mgr. Terezie Slámová
V originále
Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Mezi faktory, jež ovlivňují etiopatogenezi OSCC se řadí mj. orální dysbióza a malhygiena. Ve srovnání s ozubenými mají lidé s úplnou ztrátou zubů (podobně jako lidé s dobrou orální hygienou) méně diverzní orální bakteriom. Ve studiích kontrol a případů byla pozorována významně větší bakteriální diverzita na povrchu tumoru u pacientů s OSCC ve srovnání se vzorky zdravé orální mukózy u kontrol. Cílem této pilotní studie bylo analyzovat a srovnat bakteriom na povrchu tumoru a z dentálního plaku a zjistit, zda se bakteriální osídlení povrchu tumoru liší v závislosti na stavu dentice u pacientů s OSCC. Metody: 32 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC jsme rozdělili do 3 skupin dle stavu jejich dentice na bezzubé, málo ozubené (<16 zubů) a více ozubené (≥16 zubů). U všech byl odebrán stěr z povrchu tumoru a u ozubených navíc i stěr dentálního plaku. Mikrobiální DNA jsme izolovali pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále jsme provedli amplifikaci hypervariabilní oblasti 16S rRNA a připravili knihovnu pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Alfa diverzita bakteriomu byla srovnatelná v matricích získaných stěrem z tumoru a dentálního plaku (p > 0,05). V obou typech vzorků patřily mezi jedny z nejvíce zastoupených rodů Streptococcus, Fusobacterium a Porphyromonas. Nalezli jsme rozdíl v bakteriální diverzitě (dle ASV) z povrchu tumoru při porovnání bezzubých pacientů a pacientů málo ozubených (<16 zubů; p < 0,05); u více ozubených pacientů jsme pozorovali pouze obdobný trend (p > 0,05). Relativní abundance rodu Dialister sp. na povrchu tumoru byla vyšší u málo ozubených ve srovnání s více ozubenými pacienty (p < 0,05), zatímco mezi bezzubými a málo ozubenými nebyl v tomto rozdíl (p > 0,05). Úroveň orální hygieny i počet ASV u vzorků dentálního plaku byli podobné mezi skupinami ozubených pacientů (p > 0,05). Shrnutí: Výsledky naší pilotní studie ukázaly, že pacienti zcela bez zubů mají nižší bakteriální diverzitu na povrchu tumoru než ti ozubení. To potvrzuje hypotézu, že orální bakteriom u pacientů s OSCC je ovlivněn stavem jejich dentice.
In English
Introduction: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the most common malignancy in the head and neck region. Factors influencing the etiopathogenesis of OSCC include oral dysbiosis and malhygiene. Compared to dentate people, people with complete tooth loss (similar to people with good oral hygiene) have less oral bacteriomyoma diversion. In studies of controls and cases, significantly greater bacterial diversity was observed on the tumor surface in patients with OSCC compared to healthy oral mucosa samples in controls. The aim of this pilot study was to analyze and compare the bacteriome on the tumor surface and from the dental plaque and to determine whether the bacterial colonization of the tumor surface differs according to the status of the dentition in patients with OSCC. Methods: Thirty-two patients with a histopathologically confirmed diagnosis of OSCC were divided into 3 groups according to the condition of their dentition into edentulous, under-edentulous (<16 teeth), and over-edentulous (≥16 teeth). In all of them, a swab was taken from the tumor surface and in the dentate ones, in addition, a dental plaque swab was taken. Microbial DNA was isolated using the QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), and the 16S rRNA hypervariable region was amplified and a library was prepared for next-generation sequencing on an Illumina MiSeq instrument. Results: The alpha diversity of the bacteriome was comparable in matrices obtained from tumor and dental plaque swabs (p > 0.05). In both types of samples, Streptococcus, Fusobacterium and Porphyromonas were among the most abundant genera. We found a difference in bacterial diversity (according to ASV) from the tumor surface when comparing edentulous and low-toothed patients (<16 teeth; p < 0.05); we observed only a similar trend in the more toothed patients (p > 0.05). The relative abundance of the genus Dialister sp. on the tumor surface was higher in the low-toothed compared to the more toothed patients (p < 0.05), whereas there was no difference between the no- and low-toothed patients (p > 0.05). The level of oral hygiene and the number of ASV in the dental plaque samples were similar between the toothed patient groups (p > 0.05). Summary: The results of our pilot study showed that completely edentulous patients had lower bacterial diversity on the tumor surface than the edentulous ones. This supports the hypothesis that the oral bacteriome in OSCC patients is influenced by the condition of their dentition.
Links
| LM2018121, research and development project |
| ||
| LM2018132, research and development project |
|