FEDR, Radek, Zuzana KAHOUNOVÁ, Ján REMŠÍK, Michaela REITEROVÁ, Tomáš KALINA a Karel SOUČEK. Variability of fluorescence intensity distribution measured by flow cytometry is influenced by cell size and cell cycle progression. Nature Scientific Reports. Berlin: Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-13. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-31990-1.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Variability of fluorescence intensity distribution measured by flow cytometry is influenced by cell size and cell cycle progression
Autoři FEDR, Radek (203 Česká republika), Zuzana KAHOUNOVÁ (203 Česká republika), Ján REMŠÍK (203 Česká republika), Michaela REITEROVÁ (203 Česká republika), Tomáš KALINA (203 Česká republika) a Karel SOUČEK (203 Česká republika, domácí).
Vydání Nature Scientific Reports, Berlin, Nature Research, 2023, 2045-2322.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30204 Oncology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.600 v roce 2022
Kód RIV RIV/00216224:14310/23:00132238
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-31990-1
UT WoS 001017313600005
Klíčová slova anglicky flow cytometry; cell cycle; cell size; background fluorescence
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 12. 2023 10:21.
Anotace
The distribution of fluorescence signals measured with flow cytometry can be influenced by several factors, including qualitative and quantitative properties of the used fluorochromes, optical properties of the detection system, as well as the variability within the analyzed cell population itself. Most of the single cell samples prepared from in vitrocultures or clinical specimens contain a variable cell cycle component. Cell cycle, together with changes in the cell size, are two of the factors that alter the functional properties of analyzed cells and thus affect the interpretation of obtained results. Here, we describe the association between cell cycle status and cell size, and the variability in the distribution of fluorescence intensity as determined with flow cytometry, at population scale. We show that variability in the distribution of background and specific fluorescence signals is related to the cell cycle state of the selected population, with the 10% low fluorescence signal fraction enriched mainly in cells in their G0/G1 cell cycle phase, and the 10% high fraction containing cells mostly in the G2/M phase. Therefore we advise using caution and additional experimental validation when comparing populations defined by fractions at both ends of fluorescence signal distribution to avoid biases caused by the effect of cell cycle and cell size.
Návaznosti
EF16_025/0007381, projekt VaVNázev: Preklinická progrese nových organických sloučenin s cílenou biologickou aktivitou
LX22NPO5102, projekt VaVNázev: Národní ústav pro výzkum rakoviny (Akronym: NÚVR)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní ústav pro výzkum rakoviny, 5.1 EXCELES
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Miškechová, T. 14. 11. 2023

Vlastnosti

Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf?info
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:14, Mgr. Tereza Miškechová

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Karel Souček, Ph.D., učo 18412
  • osoba Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722
Atributy
 

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.pdf
Typ souboru
PDF (application/pdf)
Velikost
2,1 MB
Hash md5
87e0700531e9e314afbf15d19056a89c
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:14

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp_Archive.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp_Archive.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp_Archive.pdf
Typ souboru
PDF/A (application/x-pdf)
Velikost
8 MB
Hash md5
fb5da1e4bdbe6332a95af6466de31ebb
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:23

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.txt

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.txt
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_ootvqijp.txt
Typ souboru
holý text (text/plain)
Velikost
58,4 KB
Hash md5
5f7bccd0db7194efe19a13655f4eadf2
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:26
Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Miškechová, T. 14. 11. 2023

Vlastnosti

Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf?info
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:14, Mgr. Tereza Miškechová

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Mgr. Karel Souček, Ph.D., učo 18412
  • osoba Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722
Atributy
 

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.pdf
Typ souboru
PDF (application/pdf)
Velikost
2,1 MB
Hash md5
87e0700531e9e314afbf15d19056a89c
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:14

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_Archive.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_Archive.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression_Archive.pdf
Typ souboru
PDF/A (application/x-pdf)
Velikost
8 MB
Hash md5
b22fb4144119b2613cc2d9bbf460515f
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:22

Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.txt

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.txt
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/publication/2339259/Variability_of_fluorescence_intensity_distribution_measured_by_flow_cytometry_is_influenced_by_cell_size_and_cell_cycle_progression.txt
Typ souboru
holý text (text/plain)
Velikost
59 KB
Hash md5
4420ef7d36ed2d5a3aba1a8178b6d052
Vloženo
Út 14. 11. 2023 15:23
Vytisknout
Nahlásit neoprávněně vložený soubor Zobrazeno: 28. 9. 2024 10:07