| BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH and Ondřej FIALA. Proteotypová klasifikace renálního karcinomu (Proteotype classification of renal cell carcinoma). In Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81. 2023. |
Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@misc{2358237,
author = {Bouchal, Pavel and Šimoník, Jan and Štefaník, Richard and Bouchalová, Pavla and Lapčík, Petr and Potěšil, David and Podhorec, Ján and Hora, Milan and Poprach, Alexandr and Fiala, Ondřej},
booktitle = {Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81},
keywords = {localized and metastatic renal cell carcinoma; tyrosine kinase inhibitors; response to treatment; relapse; prognosis},
language = {cze},
title = {Proteotypová klasifikace renálního karcinomu},
url = {http://www.onkologickedny.cz},
year = {2023}
}
TY - SLIDE
ID - 2358237
AU - Bouchal, Pavel - Šimoník, Jan - Štefaník, Richard - Bouchalová, Pavla - Lapčík, Petr - Potěšil, David - Podhorec, Ján - Hora, Milan - Poprach, Alexandr - Fiala, Ondřej
PY - 2023
TI - Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
KW - localized and metastatic renal cell carcinoma
KW - tyrosine kinase inhibitors
KW - response to treatment
KW - relapse
KW - prognosis
UR - http://www.onkologickedny.cz
N2 - Renální karcinom (RCC) představuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově druhou nejvyšší incidencí v České republice. Molekulární prognostické a prediktivní biomarkery pro RCC jsou většinově nedostupné, především pak na proteinové úrovni. Pro kvantifikaci co největšího množství proteinů spojených s tumorigenezí RCC jsme vytvořili RCC-specifickou spektrální knihovnu cílených proteomických “assays“ pro 7960 proteinových skupin (FDR=1 %). Následně jsme použili hmotnostní spektrometrii s datově nezávislým sběrem dat (DIA-MS) na LC-MS systému QExactive HF-X pro analýzu velmi dobře charakterizovaného souboru metastatických RCC tumorů (tréninkový soubor n=53, validační soubor n=22) a přilehlých nenádorových tkání (n=17), z nichž část odpovídala a část neodpovídala na léčbu tyrosinkinázovými inhibitory (TKI). Identifikovali a validovali jsme proteinový biomarker specificky spojený se špatnou odpovědí na léčbu TKI, související rovněž s časem do dosažení nejlepší léčebné odpovědi a nesouvisející s nádorovým grade a dalšími klinickopatologickými parametry. Funkční analýzy s využitím CRISPR/Cas9 knockoutu potvrdily jeho souvislost s buněčnou migrací a invazivitou ve 2D a 3D prostředí. Podobná studie byla provedena také pro identifikaci proteinů souvisejících s relapsem lokalizovaného RCC a rovněž vedla k relevantním výsledkům. Lze shrnout, že proteomika nové generace založená na DIA-MS je vysoce výkonným nástrojem pro klasifikaci tkání RCC, umožňující identifikaci prognostických biomarkerů a alternativních terapeutických cílů. Podpořeno Ministerstvem zdravotnictví ČR, projekt č. NV19-08-00250, všechna práva vyhrazena. Podpořeno projektem Národní ústav pro výzkum rakoviny (Program EXCELES, ID Projekt č. LX22NPO5102) - Financováno Evropskou unií - Next Generation EU.
ER -
BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH and Ondřej FIALA. Proteotypová klasifikace renálního karcinomu (Proteotype classification of renal cell carcinoma). In \textit{Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81}. 2023.
|
