a 2023

Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Eva KLVAŇOVÁ, Michal BARTOŠ, Milan URÍK, Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom

Name (in English)

Laboratories for microbiome analysis - ear, nasal, and oral bacteriome

Authors

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Eva KLVAŇOVÁ (203 Czech Republic), Michal BARTOŠ (203 Czech Republic), Milan URÍK (703 Slovakia), Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ (703 Slovakia), Pavel HORNÍK (203 Czech Republic), Petra BRENEROVÁ (203 Czech Republic), Lenka BODOKYOVÁ (703 Slovakia), Pavla HOLOCHOVÁ (203 Czech Republic), Jana VRZALOVÁ (203 Czech Republic), Jan BÖHM (203 Czech Republic), Vojtěch BARTOŇ (203 Czech Republic), Petra RŮŽIČKOVÁ (203 Czech Republic) and Jana KLÁNOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Otologický den, 2023

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

10608 Biochemistry and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/23:00133572

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

infrastructure; microbiome
Změněno: 19/2/2024 13:33, Mgr. Terezie Slámová

Abstract

V originále

Výzkumná činnost centra RECETOX je podporována nejmodernější výzkumnou infrastrukturou, která je částečně centralizovaná do samostatných jednotek, tzv. core facilit. Výzkumná infrastruktura funguje na principu „open access“, v rámci kterého poskytuje své kapacity interním i externím uživatelům z akademické i průmyslové sféry. Součástí našich Centrálních laboratoří je také core facilita Laboratoře analýzy mikrobiomu, ve které se zabýváme analýzou mikrobiomu humánních, animálních i environmentálních vzorků, a to s využitím moderních metod sekvenování nové generace. Kromě vlastní analýzy vzorků, nabízíme i pomoc s designem metagenomických studií, vyhodnocením a interpretací sekvenačních dat. Lidský mikrobiom, neboli soubor genetické informace mikrobioty, je specifický pro lokalitu, ze které pochází. V orofaciální oblasti je dosud nejvíce prostudován orální mikrobiom, v době pandemie Covid-19 se významně více studií začalo věnovat mikrobiomu nasálnímu a nasopharyngeálnímu. Mezi mikrobiomem dutiny ústní a nosní a mikrobiomem ucha mohou být specifické vztahy, kdy dochází k vzájemnému ovlivnění, především pak u malých dětí. Mikrobiom ucha, nejen vnějšího ale i středního, je předmětem zájmu našeho výzkumu u pacientů s akutní nebo s chronickou otitis media.

In English

The research activities of the RECETOX Centre are supported by state-of-the-art research infrastructure, which is partially centralised in separate units, the so-called core facilities. The research infrastructure operates on the principle of "open access", providing its capacity to internal and external users from both academia and industry. Our Central Laboratories also include a core facility, the Microbiome Analysis Laboratory, where we analyse the microbiome of human, animal and environmental samples using modern next-generation sequencing methods. In addition to actual sample analysis, we offer assistance with metagenomic study design, evaluation and interpretation of sequencing data. The human microbiome, or the set of genetic information of the microbiota, is specific to the location from which it originates. In the orofacial region, the oral microbiome has been the most studied to date, with significantly more studies beginning to focus on the nasal and nasopharyngeal microbiome at the time of the Covid-19 pandemic. There may be specific relationships between the oral and nasal microbiome and the ear microbiome, where there are interactions, particularly in young children. The microbiome of the ear, not only the external but also the middle ear, has been the focus of our research in patients with acute or chronic otitis media.

Links

EF17_043/0009632, research and development project
Name: CETOCOEN Excellence
LM2023069, research and development project
Name: Výzkumná infrastruktura RECETOX
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, RECETOX research infrastructure