Bakteriom středního ucha u dětí a mladých dospělých s retrakční kapsou a cholesteatomem

BARTOŠ, Michal, Milan URÍK, Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ and eva BUDÍNSKÁ. Bakteriom středního ucha u dětí a mladých dospělých s retrakční kapsou a cholesteatomem (Bacterioma of the middle ear in children and young adults with retraction pocket and cholesteatoma). In Otologické dny. 2023.

Basic information

• Original name: Bakteriom středního ucha u dětí a mladých dospělých s retrakční kapsou a cholesteatomem
• Name (in English): Bacterioma of the middle ear in children and young adults with retraction pocket and cholesteatoma
• Authors: BARTOŠ, Michal (203 Czech Republic), Milan URÍK (703 Slovakia), Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Lucie BUREŠOVÁ (203 Czech Republic), Pavla HOLOCHOVÁ (203 Czech Republic) and eva BUDÍNSKÁ.
• Edition: Otologické dny, 2023.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10608 Biochemistry and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/23:00133578
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: bacteriome; otitis; cholesteatoma

Abstract

Úvod: Chronický zánět středního ucha (COM) je velmi časté onemocnění středního ucha u dětí a mladých dospělých. Hlavními příčinami jsou dysfunkce Eustachovy trubice a bakteriální infekce. Cílem této pilotní studie bylo popsat a porovnat bakteriom středního ucha u dětí a mladých dospělých se závažnými formami COM, jako je cholesteatom a retrakční kapsa bubínku, s bakteriomem zdravého středouší. Metodika: V této případové studii byly provedeny výtěry ze středoušní dutiny během operace u dětí s cholesteatomem (N=23) nebo retrakční kapsy (N=26) a u dětí indikovaných ke kochleárnímu implantátu (N=15, kontroly). Po extrakci genomové DNA následovalo vytvoření knihovny genů 16S rDNA a sekvenování na přístroji MiSeq. Vzorky s relativní četností alespoň jednoho bakteriálního rodu >20 % byly považovány za pozitivní pro konkrétní rod. Výsledky: Bakteriální diverzita byla obecně nízká ve vzorcích středního ucha od pacientů s COM, přičemž ve vzorku obvykle dominoval obsah DNA z jedné nebo dvou bakterií. Významný rozdíl v pozitivitě na jeden nebo více bakteriálních rodů byl pozorován mezi pacienty s cholesteatomem nebo retrakční kapsou (38,8 %) oproti pacientům indikovaným ke kochleárnímu implantátu (6,7 %). Závěr: Zatímco bakteriom středního ucha v případech cholesteatomu a retrakční kapsy se lišil od bakteriomu kontrolní skupiny, nálezy u obou patologických stavů byly podobné. Tyto výsledky podporují tvrzení, že retrakční kapsa je stádiem před cholesteatomem.

Abstract (in English)

Introduction: Chronic otitis media (COM) is a very common middle ear disease in children and young adults. The main causes are Eustachian tube dysfunction and bacterial infections. The aim of this pilot study was to describe and compare middle ear bacteraemia in children and young adults with severe forms of COM, such as cholesteatoma and retraction pocket of the eardrum, with bacteraemia of the healthy middle ear. METHODS: In this case study, middle ear swabs were taken during surgery in children with cholesteatoma (N=23) or retraction pocket (N=26) and in children referred for cochlear implant (N=15, controls). Genomic DNA extraction was followed by 16S rDNA gene library construction and sequencing on the MiSeq instrument. Samples with a relative frequency of at least one bacterial genus >20% were considered positive for a specific genus. RESULTS: Bacterial diversity was generally low in middle ear samples from patients with COM, with DNA from one or two bacteria typically dominating the sample. A significant difference in positivity for one or more bacterial genera was observed between patients with a cholesteatoma or retraction pocket (38.8%) versus those indicated for a cochlear implant (6.7%). CONCLUSION: While the middle ear bacterioma in cases of cholesteatoma and retraction pocket differed from that of the control group, the findings in both pathologies were similar. These results support the claim that the retraction pocket is a stage before cholesteatoma.

Links

• LM2023069, research and development project: Name: Výzkumná infrastruktura RECETOX

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, RECETOX research infrastructure