Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Katarína GREŠOVÁ, David PROCHÁZKA, Viktória SPIŠAKOVÁ, Adrián ROŠINEC, Jakub ČILLÍK, Pavlína ŠPRINGEROVÁ, Aleš KŘENEK, Vlastislav DOHNAL, Radka SVOBODOVÁ and Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Available from: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.

Basic information

Original name

Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

Authors

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Katarína GREŠOVÁ, David PROCHÁZKA, Viktória SPIŠAKOVÁ, Adrián ROŠINEC, Jakub ČILLÍK, Pavlína ŠPRINGEROVÁ, Aleš KŘENEK, Vlastislav DOHNAL, Radka SVOBODOVÁ and Matej ANTOL

Edition

ELIXIR CZ Annual Conference, 2024

---

Other information

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

URL

DOI

http://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281

Tags

AlphaFind, AlphaFold, DISA, embeddings, learned indexing, LMI, protein structure, similarity search

Tags

International impact

---

Links

GF23-07040K, research and development project	Name: Naučené indexy pro podobností hledání Investor: Czech Science Foundation, Learned Indexing for Similarity Searching, Lead Agency
LM2023055, research and development project	Name: Česká národní infrastruktura pro biologická data Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, ELIXIR-CZ: Czech National Infrastructure for Biological Data
MUNI/A/1590/2023, interní kód MU	Name: Využití technik umělé inteligence pro zpracování dat, komplexní analýzy a vizualizaci rozsáhlých dat Investor: Masaryk University, Using artificial intelligence techniques for data processing, complex analysis and visualization of large-scale data
752/2024, interní kód MU	Name: Nástroj na automatickou anotaci a prohledávání velkých sad proteinů na základě podobnosti jejich struktur Investor: CESNET