2024
ROZŠÍŘENÁ MOLEKULÁRNÍ DIAGNOSTIKA DOSPĚLÝCH PACIENTŮ S ALL V ČR
POLÍVKOVÁ, V., J. KŘÍŽKOVÁ, P. SUCHÁNKOVÁ, Zuzana VRZALOVÁ, A. LÁZNIČKA et. al.Basic information
Original name
ROZŠÍŘENÁ MOLEKULÁRNÍ DIAGNOSTIKA DOSPĚLÝCH PACIENTŮ S ALL V ČR
Name (in English)
Molecular Diagnostics of Adult ALL Patients in the Czech Republic
Authors
POLÍVKOVÁ, V., J. KŘÍŽKOVÁ, P. SUCHÁNKOVÁ, Zuzana VRZALOVÁ (203 Czech Republic), A. LÁZNIČKA, Jiří ŠTIKA (203 Czech Republic, belonging to the institution), Henrieta HAĽAMOVÁ (703 Slovakia), Štěpán HRABOVSKÝ (203 Czech Republic), Ivan Marin MARINOV, Š. RANSDORFOVÁ, JM. HORÁČEK, Zdeněk KOŘÍSTEK (203 Czech Republic), Michael DOUBEK (203 Czech Republic), Kateřina MACHOVÁ POLÁKOVÁ (203 Czech Republic) and C. ŠÁLEK
Edition
III. ČESKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD in Transfuze a Hematologie Dnes, 2024
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Conference abstract
Field of Study
30204 Oncology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
is not subject to a state or trade secret
References:
RIV identification code
RIV/00216224:14740/24:00137881
Organization unit
Central European Institute of Technology
Keywords (in Czech)
ALL; BCR; subtyp; diagnostika
Keywords in English
ALL; BCR; subtype; diagnostics
Tags
Tags
Reviewed
Changed: 28/2/2025 10:00, Mgr. Eva Dubská
V originále
Akutní lymfoblastová leukemie (ALL) představuje 20 % akutních leukemií u dospělých. S vyšším věkem narůstá podíl prognosticky nepříznivých subtypů jako je BCR::ABL1 pozitivní a BCR::ABL1-like ALL. 5leté celkové přežití je výrazně nižší u dospělých ALL pacientů (50 %) než u dětských (90 %). V roce 2023 jsme v rámci České leukemické skupiny pro život zahájili multicentrickou činnost v oblasti rozšířené molekulární diagnostiky ALL. Moderní genomické metody založené na masivně paralelním sekvenování umožnují spolehlivě stanovit subtyp B-nebo T-ALL. Transkriptomové sekvenování poskytuje data o genovém expresním profilu, přítomných genových fúzí a somatických variantách. Panelové sekvenování spolu s celoexomovým sekvenováním doplňuje informace o výskytu somatických variant asociovaných s jednotlivými subtypy ALL. Další používanou metodou je MLPA/ digitální MLPA, která detekuje změny v počtu kopií DNA segmentů tzn. delece a amplifikace genů nebo jejich částí s možností určit i přítomnost profilu IKZF1plus. Součástí rozšířené diagnostiky je i ex vivo testování citlivosti primárních buněk pacientů s T-ALL k venetoclaxu a dasatinibu. Výstupy těchto metod spolu se standardní laboratorní diagnostikou (cytogenetické analýzy, flowcytometrie, myelogram) zpřesňují určení subtypu ALL a stanovení stratifikačního rizika. Dosud bylo vyšetřeno 26 pacientů v době diagnózy (16 B-ALL; 4 MPAL; 6 T-ALL), kdy se podařilo u všech B-ALL určit molekulární subtyp (3× ZNF384r; 3× KMT2Ar; 2× BCR::ABL1-like a další). U všech T-ALL a 3/ 4 MPAL pacientů byly detekovány patogenní somatické mutace. Možnost zařazení pacientů do jednotlivých subtypů ALL podle aktuálních klasifikací WHO 2022 a ICC 2022 umožňuje intenzifikovat léčebný přístup u pacientů s vysokým rizikem, a tím zvýšit úspěšnost léčby.
In English
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) accounts for 20% of acute leukemias in adults. With increasing age, the proportion of prognostically unfavorable subtypes, such as BCR::ABL1-positive and BCR::ABL1-like ALL, rises. The 5-year overall survival rate is significantly lower in adult ALL patients (50%) compared to pediatric patients (90%). In 2023, within the Czech Leukemia Group for Life, we launched a multicenter initiative focusing on expanded molecular diagnostics of ALL. Modern genomic methods based on massively parallel sequencing enable reliable classification of B- or T-ALL subtypes. Transcriptome sequencing provides data on gene expression profiles, gene fusions, and somatic variants. Panel sequencing, along with whole-exome sequencing, supplements information on the occurrence of somatic variants associated with specific ALL subtypes. Another method used is MLPA/digital MLPA, which detects copy number variations (CNVs), including gene deletions and amplifications, with the ability to determine the presence of the IKZF1plus profile. As part of the expanded diagnostics, ex vivo testing of primary T-ALL patient cells for sensitivity to venetoclax and dasatinib is also conducted. The integration of these methods with standard laboratory diagnostics (cytogenetic analyses, flow cytometry, and myelogram) improves the accuracy of ALL subtype classification and risk stratification. To date, 26 patients have been examined at diagnosis (16 B-ALL, 4 MPAL, 6 T-ALL), with molecular subtypes successfully identified in all B-ALL cases (including 3× ZNF384r, 3× KMT2Ar, 2× BCR::ABL1-like, and others). Pathogenic somatic mutations were detected in all T-ALL cases and 3 out of 4 MPAL patients. The ability to classify patients according to the latest WHO 2022 and ICC 2022 classifications allows for treatment intensification in high-risk patients, thereby improving treatment success rates.
Links
| LX22NPO5102, research and development project |
| ||
| NU22-03-00210, research and development project |
|
