ŠTĚPÁN, Jiří, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Stanislav ROSYPAL, Václav HÁJEK a Jiří DOŠKAŘ. Identification of Staphylococcus aureus based on PCR amplification of species specific genomic 826 bp sequence derived from a common 44-kb SmaI restriction fragment. Online. Molecular and Cellular Probes. London: Academic Press LTD., 2001, roč. 15, č. 5, s. 249-257. ISSN 0890-8508. [citováno 2024-04-24]
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Identification of Staphylococcus aureus based on PCR amplification of species specific genomic 826 bp sequence derived from a common 44-kb SmaI restriction fragment
Autoři ŠTĚPÁN, Jiří (203 Česká republika), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika), Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika), Stanislav ROSYPAL (203 Česká republika), Václav HÁJEK a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika, garant)
Vydání Molecular and Cellular Probes, London, Academic Press LTD. 2001, 0890-8508.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW [Abstract] [Full text]
Impakt faktor Impact factor: 1.588
Kód RIV RIV/00216224:14310/01:00004693
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky Staphylococcus aureus; polymerase chain reaction; species-specific probe; 44-kb SmaI fragment L of NCTC 8325; molecular identification
Štítky molecular identification, polymerase chain reaction, species-specific probe, Staphylococcus aureus
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 15. 2. 2008 10:14.
Anotace
Primers were designed for polymerase chain reaction (PCR)-amplification of a genomic sequence specific to Staphylococcus aureus strains. The sequence corresponds to a part of the 44-kb Smal fragment (fragment L on the S. aureus NCTC 8325 restriction map) which was found to be common to strains of the S. aureus species (Pantucek et al., 1996, International journal of Systematic Bacteriology, 46: 216-222). The labelled 44-kb Smal restriction fragment derived from S. aureus NCTC 8325-4 was hybridized to the EcoRI restriction patterns of genomic DNA from 13 strains representing different macrorestriction types of S. aureus subsp. aureus. This made it possible to reveal the 2052 bp EcoRI restriction subfragment and to demonstrate its presence in all the tested strains. From the sequence of this subfragment, primers were designed by means of which the 826 bp amplicons were obtained in all 216 tested strains of S. aureus. No hybridization and PCR-products were observed in 40 collection strains of other staphylococcal species and subspecies as well as in 45 clinical strains of coagulase-negative staphylococci. These results lead us to the conclusion that the use of the above primers makes it possible to identify rapidly and reliably S. aureus strains of various provenance and different genotypes. (C) 2001 Academic Press.
Návaznosti
GA301/99/D075, projekt VaVNázev: Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
Investor: Grantová agentura ČR, Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
MSM 143100008, záměrNázev: Genomy a jejich funkce
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 09:41