Biochemická a molekulární taxonomie grampozitivních koků izolovaných z kůže lam

DOŠKAŘOVÁ, Sylva, Ivo SEDLÁČEK and Roman PANTŮČEK. Biochemická a molekulární taxonomie grampozitivních koků izolovaných z kůže lam (Biochemical and molecular taxonomy of gram-positive cocci isolated from llamas skin). In Konference mladých mikrobiologů X. Tomáškovy dny 2001. 2001.

Basic information

• Original name: Biochemická a molekulární taxonomie grampozitivních koků izolovaných z kůže lam
• Name (in English): Biochemical and molecular taxonomy of gram-positive cocci isolated from llamas skin
• Authors: DOŠKAŘOVÁ, Sylva (203 Czech Republic), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic) and Roman PANTŮČEK (203 Czech Republic).
• Edition: Konference mladých mikrobiologů X. Tomáškovy dny 2001, 2001.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/01:00005400
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: Macrococcus - ribotyping - biotyping

Abstract

Makrokoky jsou grampozitivní, kataláza a oxidáza pozitivní koky vyskytující se především na kůži koní a poníků. Není známo jejich patogenní působení. Rod Macrococcus byl vyčleněn z rodu Staphyloooccus v roce 1998. Tato práce se zabývá popisem a taxonomickým zařazením 8 kmenů izolovaných z kůže lamy krotké (Lama glama, L.) chované v brněnské zoologické zahradě. Jedná se o grampozitivní, kataláza a oxidáza pozitivní koky, většinou oranžově pigmentující, které rovněž svými dalšími fenotypovými vlastnostmi odpovfdají rodu Macrococcus: Liší se však od popsaných druhů makrokoků pozitivní redukcí nitrátů, negativní hydrolýzou DNA a eskulinu a negativním okyselováním glycerolu. Obsah GC v genomové DNA se pohybuje v rozmezí 45,1 až 50,2 %. Pro přesnější taxonomické zařazení těchto kmenů byly provedeny některé molekulárně genetické metody (ribotypizace, PFGE a sekvencování genu pro 16S rRNA). Výsledky fenotypizace a genotypizace rozdělily studované kmeny do dvou homogennfch skupin a jasně odlišily analyzované kmeny od všech doposud popsaných druhů makrokoků. Jednoznačně však ukázaly, že se jedná o zástupce rodu Macrococcus. Získané výsledky naznačují, že se pravděpodobně jedná o dva nové druhy rodu Macrococcus. Defitivní potvrzení však přinesou až výsledky DNA-DNA hybridizace. Studované kmeny jsou uloženy v České sbírce mikroorganismů jako Macrococcus sp. CCM 4808 - CCM 4815.

Abstract (in English)

Macrococci are gram positive,catalase and oxidase positive cocci inhabiting skin of horses and ponnies. Their pathogenicity is unknown. The genus Macrococcus was earmarked from the genus Staphylococcus and described in 1998. Eight strains isolated from the skin of Lama glama breeded in the ZOO in Brno were described and characterized in this work. All strains studied were gram positive and catalase and oxidase positive, mostly orange-pigmented cocci. Their biochemical traits were in full agreement with the description of the genus Macrococcus. They differ from all hitherto described macrococci by their positive nitrate reduction,negative aesculin and DNA hydrolyses and negative glycerol acidification. The GC content of genomic DNAs were 45.1 - 52.2 %. Following molecular-genetic methods were done to clarify their taxonomic position: ribotyping,macrorestriction analysis and 16S rRNA gene sequencing. All phenotype and genotype analysis results obtained divided studied strains into two homegeneous groups and confirmed that they represent strains of the genus Macrococcus. Moreover,all strains were clearly dictiguished from all hitherto described macrococcal species. Our results imply that they represent two new species of the genus Macrococcus. This suggestion will be confirmed by DNA-DNA hybridisations. All strains studied were deposited in the Czech Collection of Microorganisms as Macrococcus sp. CCM 4808, CCM 4815.

Links

• GA301/99/D075, research and development project: Name: Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků

Investor: Czech Science Foundation, Genome-based diagnostics and typing of coagulase-negative staphylococci from human clinical specimens

• MSM 143100008, plan (intention): Name: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Genomes and their functions