Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové
elektroforézy

D 2002

Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy

ŠNAJDROVÁ, Lenka, Zdeněk GLATZ and D.W. ARMSTRONG

Basic information

Original name

Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy

Authors

ŠNAJDROVÁ, Lenka, Zdeněk GLATZ and D.W. ARMSTRONG

Edition

2002. vyd. Brno, Book of abstracts of 6th Meeting of biochemists and molecular biologists, p. 27-28, 2002

Publisher

MU Brno

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

CZE; bacterie

Abstract

V originále

Kapilární zónová elektroforéza (CZE) je relativně nová analytická metoda, která v současné době zaznamenává obrovský vývoj. Hlavními výhodami jsou značná diverzita v aplikačních možnostech, jednoduché provedení, minimální spotřeba vzorku a především minimální organické odpady. Vysoká účinnost a rychlost analýzy spolu s výše uvedenými metodami ji předurčují pro analýzu komplexních směsí biologické-ho původu, včetně živých bakteriálních buněk. Elektroforetická separace bakterií je založena na skutečnosti, že povrch bakteriálních buněk je pokryt nabitými polymery (sialové kyseliny, polysacharidy, lipopolysacharidy a proteiny), které nesou velké množství ionizovatelných skupin (karboxylové, fosfátové, sulfátové skupiny a aminoskupiny). Na povrchu buňky jsou většinou přítomny kladně i záporně nabité skupiny, a buněčný povrch je tedy amfoterní. Při vyšších hodnotách pH je celkový náboj záporný, při nižších hodnotách pH kladný. Zastoupení polymerů na povrchu bakteriální buňky je dáno především genetickou výbavou mikroorganismu, ale i růstovými podmínkami. V tekutých médiích interagují ionizovatelné polymery na povrchu buňky s protiionty z okolního média, a vzniká tak elektrická dvojvrstva, která určuje celkový elektrokinetický potenciál buňky. Elektrokinetický potenciál je ovlivňován mnoha faktory, např. typem bakterie a jejím stářím, ale také růstovými podmínkami (pH, iontová síla a chemické složení okolního média). Je-li během elektroforetického procesu složení média neměnné, dá se předpokládat, že na základě odlišného elektrokinetického potenciálu dojde k separaci bakterií, které byly kultivovány za odlišných podmínek. Byla studována elektroforetická separace různých bakterií za různých experimentálních podmínek. Nesmírně důležité je složení pracovního pufru, který narozdíl od běžných pufrů používaných v CZE obsahuje navíc 0,025% polyethylenoxidu (PEO). Tento polymer způsobuje dynamickou deaktivaci kapiláry, což je nezbytnou podmínkou pro úspěšnou separaci bakteriálních buněk. Bylo zjištěno, že s nejvyšší účinností a reprodukovatelností se dají separovat bakterie mléčného kvašení (Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus rhamnosus, Bifidus infantis).

Links

GA525/00/0785, research and development project

Name: Acidifikační procesy v sulfidových odpadech

Investor: Czech Science Foundation, Acidification processes in sulfide wastes

Citovat

ŠNAJDROVÁ, Lenka, Zdeněk GLATZ and D.W. ARMSTRONG. Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy (Separation of bacterie by capillary zone electrophoresis). In Book of abstracts of 6th Meeting of biochemists and molecular biologists. 2002nd ed. Brno: MU Brno, 2002, p. 27-28.

@inproceedings{403279,
   author = {Šnajdrová, Lenka and Glatz, Zdeněk and Armstrong, D.W.},
   address = {Brno},
   booktitle = {Book of abstracts of 6th Meeting of biochemists and molecular biologists},
   edition = {2002},
   keywords = {CZE; bacterie},
   language = {eng},
   location = {Brno},
   pages = {27-28},
   publisher = {MU Brno},
   title = {Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy},
   year = {2002}
}

TY  - JOUR
ID  - 403279
AU  - Šnajdrová, Lenka - Glatz, Zdeněk - Armstrong, D.W.
PY  - 2002
TI  - Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy
PB  - MU Brno
CY  - Brno
KW  - CZE
KW  - bacterie
N2  - Kapilární zónová elektroforéza (CZE) je relativně nová analytická metoda, která v současné době zaznamenává obrovský vývoj. Hlavními výhodami jsou značná diverzita v aplikačních možnostech, jednoduché provedení, minimální spotřeba vzorku a především minimální organické odpady. Vysoká účinnost a rychlost analýzy spolu s výše uvedenými metodami ji předurčují pro analýzu komplexních směsí biologické-ho původu, včetně živých bakteriálních buněk. Elektroforetická separace bakterií je založena na skutečnosti, že povrch bakteriálních buněk je pokryt nabitými polymery (sialové kyseliny, polysacharidy, lipopolysacharidy a proteiny), které nesou velké množství ionizovatelných skupin (karboxylové, fosfátové, sulfátové skupiny a aminoskupiny). Na povrchu buňky jsou většinou přítomny kladně i záporně nabité skupiny, a buněčný povrch je tedy amfoterní. Při vyšších hodnotách pH je celkový náboj záporný, při nižších hodnotách pH kladný. Zastoupení polymerů na povrchu bakteriální buňky je dáno především genetickou výbavou mikroorganismu, ale i růstovými podmínkami. V tekutých médiích interagují ionizovatelné polymery na povrchu buňky s protiionty z okolního média, a vzniká tak elektrická dvojvrstva, která určuje celkový elektrokinetický potenciál buňky. Elektrokinetický potenciál je ovlivňován mnoha faktory, např. typem bakterie a jejím stářím, ale také růstovými podmínkami (pH, iontová síla a chemické složení okolního média). Je-li během elektroforetického procesu složení média neměnné, dá se předpokládat, že na základě odlišného elektrokinetického potenciálu dojde k separaci bakterií, které byly kultivovány za odlišných podmínek. Byla studována elektroforetická separace různých bakterií za různých experimentálních podmínek. Nesmírně důležité je složení pracovního pufru, který narozdíl od běžných pufrů používaných v CZE obsahuje navíc 0,025% polyethylenoxidu (PEO). Tento polymer způsobuje dynamickou deaktivaci kapiláry, což je nezbytnou podmínkou pro úspěšnou separaci bakteriálních buněk. Bylo zjištěno, že s nejvyšší účinností a reprodukovatelností se dají separovat bakterie mléčného kvašení (Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus rhamnosus, Bifidus infantis).
ER  -

ŠNAJDROVÁ, Lenka, Zdeněk GLATZ and D.W. ARMSTRONG. Separace bakteriálních buněk pomocí kapilární zónové elektroforézy (Separation of bacterie by capillary zone electrophoresis). In \textit{Book of abstracts of 6th Meeting of biochemists and molecular biologists}. 2002nd ed. Brno: MU Brno, 2002, p.~27-28.

Detailed Information on Publication Record