Detailed Information on Publication Record
2002
Variabilita DNA v okruhu Poa pratensis v České republice
STONEBERG HOLT, Sierra Dawn, Lucie HOROVÁ and Petr BUREŠBasic information
Original name
Variabilita DNA v okruhu Poa pratensis v České republice
Name (in English)
DNA variability of Poa pratensis agg. in the Czech Republic
Authors
STONEBERG HOLT, Sierra Dawn (840 United States of America, guarantor, belonging to the institution), Lucie HOROVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, belonging to the institution)
Edition
Praha, IXth Congress of the Czech Botanical Society / IX. Sjezd České botanické společnosti: Abstracts, p. 107-108, 2002
Publisher
Česká botanická společnost
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Publication form
printed version "print"
RIV identification code
RIV/00216224:14310/02:00006429
Organization unit
Faculty of Science
ISBN
80-86632-02-4
Keywords in English
Flow cytometry; cpDNA; restriction analysis; trnL-trnF
Tags
International impact
Změněno: 26/3/2019 21:49, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.
V originále
Analýza množství jaderné DNA průtokovou cytometrií a nekódující chloroplastové DNA pomocí restrikční analýzy potvrdila variabilitu DNA v okruhu Poa pratensis v rámci České republiky. Množství celkové jaderné DNA bylo určeno pro padesát dvě rostliny ze sedmnácti lokalit z České republiky, převážně z Moravy. Největší množství DNA obsahovalo sedm vzorků rostlin z okolí Chrudimi. Pomocí standartu (rostlina o známém váhovém množství DNA a zároveň s přesně určeným množstvím chromozomů) bylo množství jaderné DNA přepočteno na množství chromozomů a tímto byl jejich počet stanoven na šedesát osm až osmdesát jeden chromosom. Stejným postupem byl počet chromosomů určen u dalších vzorků. Čtrnáct rostlin z okolí Brna mělo podle výpočtů třicet jeden až padesát šest chromosomů. Dvě rostliny z Moravského krasu měly třicet dva chromosomy. Rostliny na jih od Brna měly všechny nízké množství jaderné DNA, které odpovídalo třiceti až čtyřiceti pěti chromosomům. Z toho lze usuzovat na možnost, že v Panonii mají zástupci okruhu Poa pratensis menší obsah jaderné DNA než v jiných oblastech. Pro další posouzení variability Poa pratensis bylo použito úseku chloroplastové DNA, kterým byla nekódující sekvence trnL intronu a trnL-trnF intergenového spaceru. Provedli jsme restrikční analýzu s použitím endonukleáz Alu I, BsaJ I a Bsm I. Jako vzor byly použity tři odrůdy, pocházející ze Šlechtitelské stanice Hladké Životice. U nich byly nalezeny tři typy této sekvence, které byly označeny písmeny MM, MS a HM. Ve sto dvaceti vzorcích pocházejících z Evropy, Severní Ameriky a Asie byly pak tyto tři typy nalezeny také plus jeden další, který se u vzorových kultivarů nevyskytoval. Celkový počet analyzovaných rostlin z České republiky byl dvacet tři, z toho sekvenci chloroplastové DNA typu MS měly rostliny z okolí Brna, jedna z okolí Chrudimi, dvě z jižních Čech, dále pak z Moravského krasu a z jižní Moravy. Sekvenci DNA typu MM měla jedna rostlina z Ostopovic u Brna a jedna z okolí Chrudimi. Konečně sekvenci DNA typu HM měla pouze jedna rostlina a to z Ivančic u Brna. Je zajímavé, že na tak poměrně malém území byly nalezeny téměř všechny typy, jako na různých místech severní polokoule. Nebyla nalezena souvislost mezi typem sekvence chloroplastové DNA a určeným množstvím jaderné DNA u dané rostliny.
In English
Analysis of total DNA content by flow cytometry and of noncoding chloroplast DNA using restriction enzymes indicated DNA variability in Poa pratensis agg. within the Czech Republic. Total DNA content was measured for 52 plants from seventeen locations in the Czech Republic, primarily from Moravia. The greatest DNA content was found in 7 plants from the Chrudim area. Using a standard (a plant with a known amount of DNA and precise chromosome count) the amount of nuclear DNA was converted to chromosome number, which spanned from 68 to 81 chromosomes. This method was used for all measurements. 14 plants from the Brno area had (according to this conversion) 31 to 56 chromosomes. Two plants from the Moravian karst had 32 chromosomes. Plants from south of Brno all had low amounts of nuclear DNA, from 30 to 45 chromosomes. It is possible to consider that the Panonian representatives of Poa pratensis agg. contain less nuclear DNA than those of other areas. Variability was also studied using the noncoding trnL intron and trnL-F intergenic spacer from the chloroplast. Restriction analysis was carried out using Alu I, BsaJ I, and Bsm I. Three cultivars from the Plant Breeding Station Hladké Životice were used as models. Three types of sequence, labeled MM, MS and HM were found within them. In 120 samples from Europe, North America and Asia these three types were found as well as one additional type. The total number of analyzed plants from the Czech Republic was 23, of which type MS was found in plants from the Brno area, one from Chrudim, 2 from South Bohemia, from the Moravian Karst and from Southern Moravia. Type MM was found in one plant from Ostopovice u Brna and one from the Chrudim area. Type HM was found in only one plant from Ivančice u Brna. It is interesting that in such a small area, nearly all the types found in various places in the Northern Hemisphere were found. No relationship was found between the type of chloroplast DNA and the amount of nuclear DNA for a given plant.
Links
| MSM 143100010, plan (intention) |
|