Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@article{406336,
author = {Oráčová, Eva and Kvardová, Veronika and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří},
article_location = {Brno},
article_number = {1},
keywords = {Bacterial Typing Techniques; DNA; Bacteriophages; Staphylococcus aureus; Lysogeny; Multiplex PCR; Prophage detection},
language = {cze},
issn = {1210-6267},
journal = {Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela},
note = {Genetická konference - Perspektivy genetiky, genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002},
title = {Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí multiplex PCR},
volume = {24},
year = {2002}
}
TY - JOUR
ID - 406336
AU - Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří
PY - 2002
TI - Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aureus pomocí multiplex PCR
JF - Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela
VL - 24
IS - 1
SP - 37
EP - 37
PB - Genetická společnost Gregora Mendela
SN - 12106267
N1 - Genetická konference - Perspektivy genetiky, genomy a genová exprese, Brno 5.-6. 2. 2002
KW - Bacterial Typing Techniques
KW - DNA
KW - Bacteriophages
KW - Staphylococcus aureus
KW - Lysogeny
KW - Multiplex PCR
KW - Prophage detection
N2 - V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vyhledány sekvence specific-ké pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A, 5 003 bp), B (fág 53, 3 926 bp), F (fág 77, 3 398 bp) a L (fág 187, 1 927 bp). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sond stanoveny sekvence a navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti (pro fágy serologické skupiny A: 3A-F 5' CTT TGA CAT GAC ATC CGC TTG AC 3' a 3A-R 5' TAT CAG GCG AGA ATT AAG GG 3', produkt 745 bp; pro fágy serologické skupiny B: 53-F 5' ACT TAT CCA GGT GGY GTT ATT G 3' a 53-R 5' TGT ATT TAA TTT CGC CGT TAG TG 3', produkt 405 bp; pro fágy serologické skupiny F: 77-F 5' TAC GGG AAA ATA TTC GGA AG 3' a 77-R 5' ATA ATC CGC ACC TCA TTC CT 3', produkt 548 bp a pro fágy serologické skupiny L produkt 850 bp). Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na uměle lyzogenizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na kmenech z klinického materiálu. S využitím této techniky byly prokázány významné rozdíly v obsahu profágů u meticilin-rezistentních kmenů. Srovnání diskriminační schopnosti několika genotypizačních metod (PFGE, ribotypizace) prokázalo, že stanovení rozdílů v obsahu profágů představuje velmi citlivou typizační metodu, která je vhodná i pro odlišení blízce příbuzných kmenů.
ER -
ORÁČOVÁ, Eva, Veronika KVARDOVÁ, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ. Detekce profágů v kmenech $<$I$>$Staphylococcus aureus$<$/I$>$ pomocí multiplex PCR (Detection of prophages in Staphylococcus aureus strains using multiplex PCR). \textit{Informační listy Genetické společnosti Gregora Mendela}. Brno: Genetická společnost Gregora Mendela, vol.~24, No~1, p.~37. ISSN~1210-6267. 2002.
|
