J 2003

Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace

BOUCHAL, Pavel a Igor KUČERA

Základní údaje

Originální název

Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace

Název anglicky

Two-dimensional Electrophoresis in Proteomics: Principles and Applications

Autoři

BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika) a Igor KUČERA (203 Česká republika, garant)

Vydání

Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2003, 0009-2770

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Publikace v pdf formátu

Impakt faktor

Impact factor: 0.345

Kód RIV

RIV/00216224:14310/03:00007948

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000181006100005

Klíčová slova anglicky

Proteom; Proteomika; Dvourozměrná elektroforéza; Hmotnostní spektrometrie; Analýza obrazu; Databáze

Štítky

Analýza obrazu, Databáze, Dvourozměrná elektroforéza, Hmotnostní spektrometrie, Proteom, Proteomika
Změněno: 4. 6. 2004 15:58, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Proteomika, nové odvětví úzce související s genomikou, představuje komplexní analýzu proteinů buňky, tkáně či biologické tekutiny. Jádrem proteomiky je dvourozměrná elektroforéza, klíčová technologie při tvorbě proteinových map. Sestává ze speciálního postupu přípravy vzorku, isoelektrické fokusace, polyakrylamidové elektroforézy v přítomnosti dodecylsulfátu sodného a vizualizace gelu. Metodami analýzy obrazu jsou srovnávány a vyhodnocovány dvourozměrné separace komplexních směsí bílkovin v gelech a konstruovány proteinové mapy. Jednotlivé proteiny na proteinových mapách mohou být různými způsoby charakterizovány, nejčastěji hmotnostní spektrometrií, a na základě informací získaných o jejich struktuře identifikovány v databázích. Proteomické metody nacházejí smysluplné uplatnění při srovnávání komplexního proteinového složení v biologii, zvláště pak mikrobiologii a medicíně, kde mohou přispět k odhalení nových souvislostí mezi koncentrací proteinů a jejich fyziologickou funkcí.

Anglicky

Proteomics, a new branch of science related to genomics, involves complex analysis of proteins of cells, tissues or biological fluids. Proteomics is today based on two-dimensional electrophoresis, the crucial technology in making protein maps. It consists of special procedure for preparation of sample, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis and gel visualization. Two-dimensional separations of complex protein mixtures in gels are compared, evaluated by image analysis and protein maps are constructed. Individual proteins on the maps can be characterized by various methods, most frequently by mass spectrometry, and identified in databases using the information on their structure. Proteomic methods find useful applications in comparing complex protein composition in biology, especially in microbiology and medicine, where they can contribute to revealing new relations between concentrations of proteins and their physiologial functions.

Návaznosti

GA203/01/1589, projekt VaV
Název: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Investor: Grantová agentura ČR, Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Zobrazeno: 5. 11. 2024 12:13