BOUCHAL, Pavel and Igor KUČERA. Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace (Two-dimensional Electrophoresis in Proteomics: Principles and Applications). Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2003, vol. 97, No 1, p. 29-35. ISSN 0009-2770.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Dvourozměrná elektroforéza v proteomice: Principy a aplikace
Name (in English) Two-dimensional Electrophoresis in Proteomics: Principles and Applications
Authors BOUCHAL, Pavel (203 Czech Republic) and Igor KUČERA (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2003, 0009-2770.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW Publikace v pdf formátu
Impact factor Impact factor: 0.345
RIV identification code RIV/00216224:14310/03:00007948
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000181006100005
Keywords in English Proteom; Proteomika; Dvourozměrná elektroforéza; Hmotnostní spektrometrie; Analýza obrazu; Databáze
Tags Analýza obrazu, Databáze, Dvourozměrná elektroforéza, Hmotnostní spektrometrie, Proteom, Proteomika
Changed by Changed by: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Changed: 4/6/2004 15:58.
Abstract
Proteomika, nové odvětví úzce související s genomikou, představuje komplexní analýzu proteinů buňky, tkáně či biologické tekutiny. Jádrem proteomiky je dvourozměrná elektroforéza, klíčová technologie při tvorbě proteinových map. Sestává ze speciálního postupu přípravy vzorku, isoelektrické fokusace, polyakrylamidové elektroforézy v přítomnosti dodecylsulfátu sodného a vizualizace gelu. Metodami analýzy obrazu jsou srovnávány a vyhodnocovány dvourozměrné separace komplexních směsí bílkovin v gelech a konstruovány proteinové mapy. Jednotlivé proteiny na proteinových mapách mohou být různými způsoby charakterizovány, nejčastěji hmotnostní spektrometrií, a na základě informací získaných o jejich struktuře identifikovány v databázích. Proteomické metody nacházejí smysluplné uplatnění při srovnávání komplexního proteinového složení v biologii, zvláště pak mikrobiologii a medicíně, kde mohou přispět k odhalení nových souvislostí mezi koncentrací proteinů a jejich fyziologickou funkcí.
Abstract (in English)
Proteomics, a new branch of science related to genomics, involves complex analysis of proteins of cells, tissues or biological fluids. Proteomics is today based on two-dimensional electrophoresis, the crucial technology in making protein maps. It consists of special procedure for preparation of sample, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis and gel visualization. Two-dimensional separations of complex protein mixtures in gels are compared, evaluated by image analysis and protein maps are constructed. Individual proteins on the maps can be characterized by various methods, most frequently by mass spectrometry, and identified in databases using the information on their structure. Proteomic methods find useful applications in comparing complex protein composition in biology, especially in microbiology and medicine, where they can contribute to revealing new relations between concentrations of proteins and their physiologial functions.
Links
GA203/01/1589, research and development projectName: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Investor: Czech Science Foundation, Mechanisms involved in regulation of respiratory systems in denitrification bacteria by environmental factors
PrintDisplayed: 27/8/2024 00:41