J 2004

Examination of membrane protein expression in Paracoccus denitrificans by two-dimensional gel electrophoresis

BOUCHAL, Pavel and Igor KUČERA

Basic information

Original name

Examination of membrane protein expression in Paracoccus denitrificans by two-dimensional gel electrophoresis

Name in Czech

Studium exprese membránových proteinů bakterie Paracoccus denitrificans pomocí dvourozměrné elektroforézy

Authors

BOUCHAL, Pavel (203 Czech Republic) and Igor KUČERA (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Journal of Basic Microbiology, Weinheim, Germany, WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. 2004, 0233-111X

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Germany

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 0.651

RIV identification code

RIV/00216224:14310/04:00011385

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000189154600003

Keywords in English

Paracoccus denitrificans; proteome; two-dimensional gel electrophoresis

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 15/2/2007 13:09, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Abstract

V originále

The well-known metabolic versatility of the soil bacterium Paracoccus denitrificans poses a challenge for the modern proteomic approaches. We describe here the improved conditions that allow good separations and quantitative analyses of hundreds of membrane or periplasmic proteins. As an example, the results of a screening for membrane proteins associated predominantly with aerobic or anaerobic (denitrifying) modes of growth are presented.

In Czech

Půdní bakterie Paracoccus denitrificans je díky své dobře známé metabolické variabilitě slibným objektem výzkumu uskutečňovaného moderními proteomickými nástroji. V této práci popisujeme optimalizované podmínky umožňující dobrou separaci a kvantitativní analýzy stovek membránových a periplasmatických proteinů. Jako příklad aplikace této metodiky je prezentováno sledování membránových proteinů souvisejících převážně s aerobním a anaerobním (denitrifikačním) růstovým módem.

Links

GA203/01/1589, research and development project
Name: Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
Investor: Czech Science Foundation, Mechanisms involved in regulation of respiratory systems in denitrification bacteria by environmental factors