Detailed Information on Publication Record
2004
Molekulově Dynamická simulace flexibilních RNA motivů
RÁZGA, Filip, Jaroslav KOČA, Jiří ŠPONER and Neocles B. LEONTISBasic information
Original name
Molekulově Dynamická simulace flexibilních RNA motivů
Name (in English)
Molecular Dynamics simulation of flexible RNA motifs
Authors
RÁZGA, Filip (703 Slovakia), Jaroslav KOČA (203 Czech Republic), Jiří ŠPONER (203 Czech Republic, guarantor) and Neocles B. LEONTIS (840 United States of America)
Edition
1. vyd. Brno, Sborník abstraktů Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie, p. 42-42, 2004
Publisher
Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity v Brně Chemická sekce
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10403 Physical chemistry
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/04:00010020
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
RNA dynamics; flexibility
Tags
Změněno: 30/11/2004 14:19, Ing. Filip Rázga, Ph.D.
V originále
Molekulová dynamika je moderní výpočetní metoda, která umožňuje studovat funkčně významné pohyby v biomakromolekulách. Tuto metodu je možné použít rovněž pro vyhodnocení efektu mutací v RNA motivech. Molekulově dynamické simulace flexibilních a rigidních RNA motivů byly srovnány detailní strukturní a statistickou analýzou. Modulární charakter vybraných RNA motivů byl studován na škále desítek nanosekund se zaměřením na RNA-RNA interakce zprostředkované molekulami vody.
In English
Explicit-solvent molecular dynamics simulation is powerful technique for exploring the functionally relevant motions of biological macromolecules and for evaluating the effects of mutations on motif dynamics. Simulations of flexible and rigid RNA motifs will be compared by detailed statistical and structural analysis.Mechanisms for modulating functionally significant flexibility will be discussed, emphasising the role of RNA-RNA interactions mediated by solvent molecules.
Links
| LN00A016, research and development project |
|