RÁZGA, Filip, Jaroslav KOČA, Jiří ŠPONER and Neocles B. LEONTIS. Molekulově Dynamická simulace flexibilních RNA motivů (Molecular Dynamics simulation of flexible RNA motifs). In Sborník abstraktů Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie. 1st ed. Brno: Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity v Brně Chemická sekce, 2004, p. 42.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Molekulově Dynamická simulace flexibilních RNA motivů
Name (in English) Molecular Dynamics simulation of flexible RNA motifs
Authors RÁZGA, Filip (703 Slovakia), Jaroslav KOČA (203 Czech Republic), Jiří ŠPONER (203 Czech Republic, guarantor) and Neocles B. LEONTIS (840 United States of America).
Edition 1. vyd. Brno, Sborník abstraktů Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie, p. 42-42, 2004.
Publisher Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity v Brně Chemická sekce
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10403 Physical chemistry
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/04:00010020
Organization unit Faculty of Science
Keywords in English RNA dynamics; flexibility
Tags Flexibility, RNA dynamics
Changed by Changed by: Ing. Filip Rázga, Ph.D., učo 75883. Changed: 30/11/2004 14:19.
Abstract
Molekulová dynamika je moderní výpočetní metoda, která umožňuje studovat funkčně významné pohyby v biomakromolekulách. Tuto metodu je možné použít rovněž pro vyhodnocení efektu mutací v RNA motivech. Molekulově dynamické simulace flexibilních a rigidních RNA motivů byly srovnány detailní strukturní a statistickou analýzou. Modulární charakter vybraných RNA motivů byl studován na škále desítek nanosekund se zaměřením na RNA-RNA interakce zprostředkované molekulami vody.
Abstract (in English)
Explicit-solvent molecular dynamics simulation is powerful technique for exploring the functionally relevant motions of biological macromolecules and for evaluating the effects of mutations on motif dynamics. Simulations of flexible and rigid RNA motifs will be compared by detailed statistical and structural analysis.Mechanisms for modulating functionally significant flexibility will be discussed, emphasising the role of RNA-RNA interactions mediated by solvent molecules.
Links
LN00A016, research and development projectName: BIOMOLEKULÁRNÍ CENTRUM
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biomolecular Center
PrintDisplayed: 13/10/2024 19:00