J 2004

Arthrobacter nitroguajacolicus sp. nov., a novel 4-nitroguaiacol degrading actinobacterium

KOTOUČKOVÁ, Ludmila, Peter SCHUMANN, Eva DURNOVÁ, Cathrin SPRÖER, Ivo SEDLÁČEK et. al.

Basic information

Original name

Arthrobacter nitroguajacolicus sp. nov., a novel 4-nitroguaiacol degrading actinobacterium

Name in Czech

Arthrobacter nitroguajacolicus sp. nov., nová aktinobakterie degradující 4-nitroguajakol

Authors

KOTOUČKOVÁ, Ludmila (203 Czech Republic, guarantor), Peter SCHUMANN (276 Germany), Eva DURNOVÁ (203 Czech Republic), Cathrin SPRÖER (276 Germany), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic), Jiří NEČA (203 Czech Republic), Zbyněk ZDRÁHAL (203 Czech Republic) and Miroslav NĚMEC (203 Czech Republic)

Edition

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, UK, Society for General Microbiology, 2004, 1466-5026

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 3.015

RIV identification code

RIV/00216224:14310/04:00010097

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000221579500023

Keywords in English

Arthrobacter nitroguajacolicus; actinobacteria; 4-nitroguaiacol; 4-nitrophenol; 4-nitrocatechol; degradation

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 26/6/2009 10:46, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Abstract

V originále

Tři izoláty bakterií z půdy vyznačující se schopností degradace nebo transformace nitroaromatických látek a vykazující růstový cyklus tyčka-kok byly studovány s využitím polyfázického přístupu. Na základě analýzy sekvence 16S rDNA a chemotaxonomických znaků jako je peptidoglykan typu A3alfa s interpeptidickým můstkem Ala-Thr-Ala, dominantní menachinon MK-9(H2) a složení mastných kyselin byly všechny izoláty zařazeny do rodu Arthrobacter. DNA-DNA hybridizace, riboprinting a fenotypické znaky ukázaly, že izoláty patří do jednoho druhu, odlišného od fylogeneticky nejbližších A. aurescens and A. ilicis. Nový druh Arthrobacter nitroguajacolicus sp. nov. má typový kmen G2-1T (CCM 4924T, DSM 15232T).

In Czech

Three bacterial isolates from soil capable of degradation or transformation of nitroaromatic compounds and displaying a rod-coccus growth cycle were studied by a polyphasic approach. On the basis of 16S rDNA sequence analysis and chemotaxonomic characteristics such as peptidoglycan type A3alpha with an interpeptide bridge Ala-Thr-Ala, the major menaquinone MK-9(H2) and fatty acid composition, the isolates were assigned to the genus Arthrobacter. DNA-DNA hybridization, riboprinting, and phenotypic studies revealed that the three strains constitute a homogeneous species, distinct from phylogenetically neighbouring A. aurescens and A. ilicis. A novel species Arthrobacter nitroguajacolicus sp. nov. with the type strain G2-1T (CCM 4924T, DSM 15232T) is proposed.

Links

GA204/00/P095, research and development project
Name: Mikrobiální transformace organických polutantů ve směsích
Investor: Czech Science Foundation, Microbial transformation of organic pollutants in mixtures
MSM 143100005, plan (intention)
Name: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biomolecular Structure-function Relationships and their role in the Metabolism