PANTŮČEK, Roman. Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně (Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno). Online. In ŘEHOUT, V. Pedagogický software. První vydání. České Budějovice: Scientific Pedagogical Publishing, 2004. p. 551-554. ISBN 80-85645-49-1. [citováno 2024-04-23]
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně
Name (in English) Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno
Authors PANTŮČEK, Roman (203 Czech Republic, guarantor)
Edition První vydání. České Budějovice, Pedagogický software, p. 551-554, 4 pp. 2004.
Publisher Scientific Pedagogical Publishing
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/04:00010118
Organization unit Faculty of Science
ISBN 80-85645-49-1
Keywords in English bioinformatics; genomics; proteomics; education
Tags bioinformatics, Education, genomics, proteomics
Changed by Changed by: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Changed: 10/6/2004 11:16.
Abstract
Bioinformatika je nová disciplína na rozhraní počítačových věd, informačních technologií, matematiky a biologie. Termín bioinformatika se objevil poprvé až v roce 1991 a představuje spojení technologií z oblasti molekulární biologie a oblasti informačních technologií u nichž došlo v posledních letech k explozivnímu růstu nových poznatků. Zahrnuje studium a praktické uchovávání, vyhledávání, zobrazování, manipulaci a modelování biologických dat (Tabulka 1). Neodmyslitelnou součástí infrastruktury bioinformatiky je komunikační prostředek umožňující rychlý přenos obrovského množství dat a současně poskytovanou všeobecnou dostupnost k těmto datům pro tisíce lidí. V závěru dvacátého století se tímto prostředkem stal internet a obecně používaným rozhraním je webový prohlížeč, umožňující pracovat s hypertextovými a hypergrafickými prezentacemi včetně výpočetních nástrojů, podstatně přispívajících ke stanovení vztahů, struktury a funkce informačních biomakromolekul a jejich role v biologických procesech. Na internetu existuje řada kolekcí shromažďujících odkazy na volně dostupné analytické nástroje bioinformatiky. V tomto příspěvku je uvedena výuková stránka pro cvičení k předmětu Úvod do bioinformatiky, který je zařazen do povinné výuky pro magisterský studijní obor molekulární biologie a genetika na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v Brně. Cílem kurzu je zvládnutí běžných aplikací bioinformatiky potřebných pro zpracování diplomové práce z molekulární biologie, a především seznámení posluchačů s dostupnými informačními službami pro molekulární biologii. Stránka je umístěna na URL adrese http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/ a je členěná do 11 samostatných témat: Literární informační zdroje pro biomedicínské obory; Databázové zdroje pro molekulární biologii, textové vyhledávání v databázích; Metody používané při sekvencování genomů a analytické nástroje; Restrikční analýza a návrh PCR-primerů a oligonukleotidů; Hledání v databázích sekvencí nukleových kyselin: nástroje pro lokální seřazení sekvencí; Nástroje mnohonásobné a globální seřazení sekvencí DNA a proteinů; Fylogenetická analýza založená na srovnávání konzervativních genů; Počítačové vyhledávání genů a jiných funkčních oblastí genomu; Analýza sekundární struktury RNA; Klasifikace proteinů a identifikace jejich funkcí.
Abstract (in English)
neuvedena
Links
LB98226, research and development projectName: Vybudování informačního centra pro biochemický a molekulárně biologický výzkum
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, The establishment of an information centre for biochemical and molecular biological research.
PrintDisplayed: 23/4/2024 19:48