Využití informačních zdrojů na internetu v praktických
cvičeních z bioinformatiky (URL:
http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké
fakultě MU v Brně

D 2004

Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně

PANTŮČEK, Roman

Basic information

Original name

Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně

Name (in English)

Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno

Authors

PANTŮČEK, Roman (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

První vydání. České Budějovice, Pedagogický software, p. 551-554, 4 pp. 2004

Publisher

Scientific Pedagogical Publishing

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/04:00010118

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-85645-49-1

Keywords in English

bioinformatics; genomics; proteomics; education

Abstract

ORIG EN

V originále

Bioinformatika je nová disciplína na rozhraní počítačových věd, informačních technologií, matematiky a biologie. Termín bioinformatika se objevil poprvé až v roce 1991 a představuje spojení technologií z oblasti molekulární biologie a oblasti informačních technologií u nichž došlo v posledních letech k explozivnímu růstu nových poznatků. Zahrnuje studium a praktické uchovávání, vyhledávání, zobrazování, manipulaci a modelování biologických dat (Tabulka 1). Neodmyslitelnou součástí infrastruktury bioinformatiky je komunikační prostředek umožňující rychlý přenos obrovského množství dat a současně poskytovanou všeobecnou dostupnost k těmto datům pro tisíce lidí. V závěru dvacátého století se tímto prostředkem stal internet a obecně používaným rozhraním je webový prohlížeč, umožňující pracovat s hypertextovými a hypergrafickými prezentacemi včetně výpočetních nástrojů, podstatně přispívajících ke stanovení vztahů, struktury a funkce informačních biomakromolekul a jejich role v biologických procesech. Na internetu existuje řada kolekcí shromažďujících odkazy na volně dostupné analytické nástroje bioinformatiky. V tomto příspěvku je uvedena výuková stránka pro cvičení k předmětu Úvod do bioinformatiky, který je zařazen do povinné výuky pro magisterský studijní obor molekulární biologie a genetika na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v Brně. Cílem kurzu je zvládnutí běžných aplikací bioinformatiky potřebných pro zpracování diplomové práce z molekulární biologie, a především seznámení posluchačů s dostupnými informačními službami pro molekulární biologii. Stránka je umístěna na URL adrese http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/ a je členěná do 11 samostatných témat: Literární informační zdroje pro biomedicínské obory; Databázové zdroje pro molekulární biologii, textové vyhledávání v databázích; Metody používané při sekvencování genomů a analytické nástroje; Restrikční analýza a návrh PCR-primerů a oligonukleotidů; Hledání v databázích sekvencí nukleových kyselin: nástroje pro lokální seřazení sekvencí; Nástroje mnohonásobné a globální seřazení sekvencí DNA a proteinů; Fylogenetická analýza založená na srovnávání konzervativních genů; Počítačové vyhledávání genů a jiných funkčních oblastí genomu; Analýza sekundární struktury RNA; Klasifikace proteinů a identifikace jejich funkcí.

In English

neuvedena

Links

LB98226, research and development project

Name: Vybudování informačního centra pro biochemický a molekulárně biologický výzkum

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, The establishment of an information centre for biochemical and molecular biological research.

Citovat

PANTŮČEK, Roman. Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně (Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno). In ŘEHOUT, V. Pedagogický software. První vydání. České Budějovice: Scientific Pedagogical Publishing, 2004, p. 551-554. ISBN 80-85645-49-1.

@inproceedings{555633,
   author = {Pantůček, Roman and Řehout, V.},
   address = {České Budějovice},
   booktitle = {Pedagogický software},
   edition = {První vydání},
   keywords = {bioinformatics; genomics; proteomics; education},
   language = {cze},
   location = {České Budějovice},
   isbn = {80-85645-49-1},
   pages = {551-554},
   publisher = {Scientific Pedagogical Publishing},
   title = {Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 555633
AU  - Pantůček, Roman - Řehout, V.
PY  - 2004
TI  - Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně
PB  - Scientific Pedagogical Publishing
CY  - České Budějovice
SN  - 8085645491
KW  - bioinformatics
KW  - genomics
KW  - proteomics
KW  - education
N2  - Bioinformatika je nová disciplína na rozhraní počítačových věd, informačních technologií, matematiky a biologie. Termín bioinformatika se objevil poprvé až v roce 1991 a představuje spojení technologií z oblasti molekulární biologie a oblasti informačních technologií u nichž došlo v posledních letech k explozivnímu růstu nových poznatků. Zahrnuje studium a praktické uchovávání, vyhledávání, zobrazování, manipulaci a modelování biologických dat (Tabulka 1). Neodmyslitelnou součástí infrastruktury bioinformatiky je komunikační prostředek umožňující rychlý přenos obrovského množství dat a současně poskytovanou všeobecnou dostupnost k těmto datům pro tisíce lidí. V závěru dvacátého století se tímto prostředkem stal internet a obecně používaným rozhraním je webový prohlížeč, umožňující pracovat s hypertextovými a hypergrafickými prezentacemi včetně výpočetních nástrojů, podstatně přispívajících ke stanovení vztahů, struktury a funkce informačních biomakromolekul a jejich role v biologických procesech. Na internetu existuje řada kolekcí shromažďujících odkazy na volně dostupné analytické nástroje bioinformatiky. V tomto příspěvku je uvedena výuková stránka pro cvičení k předmětu Úvod do bioinformatiky, který je zařazen do povinné výuky pro magisterský studijní obor molekulární biologie a genetika na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v Brně. Cílem kurzu je zvládnutí běžných aplikací bioinformatiky potřebných pro zpracování diplomové práce z molekulární biologie, a především seznámení posluchačů s dostupnými informačními službami pro molekulární biologii. Stránka je umístěna na URL adrese http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/ a je členěná do 11 samostatných témat: Literární informační zdroje pro biomedicínské obory; Databázové zdroje pro molekulární biologii, textové vyhledávání v databázích; Metody používané při sekvencování genomů a analytické nástroje; Restrikční analýza a návrh PCR-primerů a oligonukleotidů; Hledání v databázích sekvencí nukleových kyselin: nástroje pro lokální seřazení sekvencí; Nástroje mnohonásobné a globální seřazení sekvencí DNA a proteinů; Fylogenetická analýza založená na srovnávání konzervativních genů; Počítačové vyhledávání genů a jiných funkčních oblastí genomu; Analýza sekundární struktury RNA; Klasifikace proteinů a identifikace jejich funkcí.
ER  -

PANTŮČEK, Roman. Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně (Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno). In ŘEHOUT, V. \textit{Pedagogický software}. První vydání. České Budějovice: Scientific Pedagogical Publishing, 2004, p.~551-554. ISBN~80-85645-49-1.

Detailed Information on Publication Record