J 2004

Localization of seven new late-flowering mutations on the genetic map of Arabidopsis thaliana using a newly generated CAPS marker

LÍZAL, Pavel and Jiřina RELICHOVÁ

Basic information

Original name

Localization of seven new late-flowering mutations on the genetic map of Arabidopsis thaliana using a newly generated CAPS marker

Name in Czech

Lokalizace na genetickou mapu Arabidopsis thaliana za použití nově získaného markeru CAPS

Authors

LÍZAL, Pavel (203 Czech Republic, guarantor) and Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Plant Science, Dublin, Elsevier Scientific Publisher, 2004, 0168-9452

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Ireland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 1.389

RIV identification code

RIV/00216224:14310/04:00010181

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000221677300018

Keywords in English

Arabidopsis thaliana; DNA markers; late-flowering mutants; map position

Tags

Změněno: 10/2/2005 10:06, RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

The genetic analysis of seven new late-flowering mutants is reported. One mutation was found to be recessive (dn) and six to be dominant. The relevant loci were located at distinct positions on chromosomes one and four. A new protocol for converting RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) markers to CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequences) as PCR-based markers was developed using the Arabidopsis thaliana genome database. RFLP marker MI122 was successfully converted to a CAPS, which allowed more precise mapping of five late-flowering mutations.

In Czech

V článku je popsána genetická analýza sedmi nových pozdně kvetoucích mutantů. Bylo zjištěno, že jedna mutace je recesivní povahy (dn) a zbylých šest má dominantní charakter. Uvedené geny byly lokalizovány do různých pozic na chromozomu jedna a čtyři. S využitím geonomové databáze Arabidopsis thaliana byla vyvinuta nová metodika konverze markerů RFLP na markery typu CAPS, které jsou založeny na PCR. Pomocí této metodiky byl RFLP marker MI122 úspěšně konvertován na marker CAPS, který byl následně využit pro přesné mapování pěti mutací pro pozdní kvetení.

Links

GP521/02/P127, research and development project
Name: Interakce genů pro pozdní kvetení u Arabidopsis thaliana a jejich lokalizace na genetickou mapu
Investor: Czech Science Foundation, The interaction of the late flowering genes in Arabidopsis thaliana and their localization on the genetic map
MSM 143100008, plan (intention)
Name: Genomy a jejich funkce
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Genomes and their functions