Detailed Information on Publication Record
2004
Influence of methylation pathway genes on FLC expression in Arabidopsis thaliana.
LÍZAL, Pavel, Simona BALKOVÁ and Jiřina RELICHOVÁBasic information
Original name
Influence of methylation pathway genes on FLC expression in Arabidopsis thaliana.
Name in Czech
Vliv genů metylační dráhy na expresi genu FLC u Arabidopsis thaliana
Authors
LÍZAL, Pavel (203 Czech Republic, guarantor), Simona BALKOVÁ (203 Czech Republic) and Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic)
Edition
Potsdam, 15th International Conference on Arabidopsis Research, p. 38-38, 1 pp. 2004
Publisher
Satz Druck GmbH Teltow
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Germany
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/04:00011539
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
Arabidopsis;flowering;methylation pathway;FLC gene
Změněno: 10/2/2005 10:04, RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.
V originále
Activity of FLC gene (Flowering Locus C) plays a central role in the control of flowering time in the autonomous and vernalization pathways. FLC activity is negatively regulated by other genes of both pathways. The main goal of this work was to assigne influence of the six late-flowering genes (dn, L4, L5, L6-1, L6 a Spi) of the new methylation pathway on the FLC expression. Also the effect of developmental stages, vernalization and 5-azacytidine treatment on the level of FLC mRNA in rosette leaves was analysed. Moreover the tissue distribution of FLC transcript was determined. For this purpose, reverse transcription and PCR amplification of FLC was used. All six late-flowering mutants of the methylation pathway increased level of FLC mRNA relative to control lines S96 and Di-G. For analysis of the effect of developmental stages, vernalization and 5-azacytidine treatment the level of FLC mRNA was examined in rosette leaves, which were collected from plants (L4 and Spi) before and after flowering. FLC mRNA levels were not affected either by vernalization, 5-azacytidine treatment or by plant age during vegetative and reproductive development. The tissue distribution of FLC transcript was analysed in Ler standard line and SPI late-flowering mutant. RNA was isolated from roots, stems, rosette and cauline leaves, inflorescence and siliques. FLC was expressed in all vegetative tissues but was not detectable in reproductive tissues - inflorescence and siliques. The late flowering phenotype of mutants of six different genes studied is caused by the elevated level of FLC transcript. Level of FLC transcript in rosette leaves is steady of whole life cycle of plant and is restricted only to tissues of the vegetative phase. Vernalization and 5-azacytidine treatment was not able to reduce level of FLC mRNA in rosette leaves. These results indicate that FLC expression is downregulated in the apex only after the transition to flowering.
In Czech
Gen FLC (Flowering Locus C) má centrální roli v kontrole kvetení, na níž se podílí geny autonomní a vernalizační dráhy. Aktivita genu FLC je negativně regulována geny obou těchto drah. Hlavním cílem této práce bylo stanovit vliv šesti genů pro pozdní kvetení (dn, L4, L5, L6-1, L6 a Spi) zařazených do nové metylační dráhy na expresi genu FLC. Dále byl analýzou růžicových listů zkoumán také vliv vývojových stadií, vernalizace a 5-azacytidinu na úroveň hladiny mRNA genu FLC. Vedle toho byla zkoumána též distribuce transkriptu genu FLC v jednotlivých rostlinných pletivech. Pro tento účel byla použita metoda zpětné transkripce a PCR amplifikace produktu genu FLC. U všech šesti pozdně kvetoucích mutantů metylační dráhy byla zjištěna zvýšená hladina mRNA genu FLC vzhledem ke kontrolním liniím S96 a Di-G. Pro analýzu vlivu vývojových stadií, vernalizace a 5-azacytidinu byla hladina mRNA zkoumána v růžicových listech, které byly získány z rostlin (L4 a Spi) před a po kvetení. Bylo zjištěno, že hladina mRNA genu FLC není ovlivněna ani vernalizací, působením 5-azacytidinu a ani vývojovým stadium rostliny. Distribuce FLC transkriptu byla analyzována u standardní linie Ler a u pozdně kvetoucího mutanta Spi. RNA byla izolována z kořene, stonku, růžicových a stonkových listů, květů a šešulí. Gen FLC byl exprimován ve všech vegetativních pletivech, ale exprese nebyla detekována v reprodukčních pletivech v květech a šešulích. Pozdní kvetení je u všech šesti analyzovaných genů způsobeno zvýšenou hladinou transkriptu genu FLC. Úroveň exprese zůstává zachována v růžicových listech po celou dobu vývoje rostliny a je omezena jen na vegetativní orgány. Vernalizace ani 5-azacytidin neredukují v růžicových listech hladinu mRNA genu FLC. Tyto výsledky ukazují, že exprese genu FLC je utlumena v apexu teprve až po indukci kvetení.
Links
| GP521/02/P127, research and development project |
|