Detailed Information on Publication Record
2004
Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method
SVOBODA, DavidBasic information
Original name
Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method
Name in Czech
Směrem k plně automatizované metodě segmentace tkání
Authors
SVOBODA, David (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Anaheim, Calgary, Zurich, Visualization, Imaging, and Image Processing, p. 430-434, 5 pp. 2004
Publisher
ACTA Press
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Country of publisher
Spain
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
RIV identification code
RIV/00216224:14330/04:00010272
Organization unit
Faculty of Informatics
ISBN
0-88986-454-3
UT WoS
000228556600075
Keywords in English
Biomedical image segmentation; Adaptive thresholding; Gradient based thresholding; Region labeling
Tags
Změněno: 22/1/2008 08:16, doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.
V originále
In this paper, an automatic method for tissue cell localization is proposed. It is based on the principle of adaptive thresholding. While the general adaptive thresholding method requires setting of some parameters by user, a novel algorithm chooses suitable thresholds and image division on its own. The resulting binary image is then submitted to a region labeling procedure. Each individual region is inspected and tested for suitability for further processing. Finally, each region is marked by one marker. Feasibility of this approach has already been successfully tested on 3D colon tissue images.
In Czech
V tomto článku je navržena plně automatizovaná metoda sloužící k lokalizaci buněk ve snímcích tkání. Metoda je založena na principu adaptivního prahování. Zatímco obecná metoda adaptivního prahování vyžaduje ke svému spuštění určitý počet vstupů, nová metoda je schopna tyto si parametry vhodně nastavit sama. Po odprahování výsledný binární obraz podléhá algoritmu "region labeling". Následně je každá nalezená buňka v obraze prověřena a otestována, zda je vůbec vhodná pro zařazení k dalším výpočtům. Na závěr je každá buňka opatřena značkou, která identifikuje polohu této buňky v rámci celého snímku tkáně. Vhodnost této metody již byla úspěšně prověřena na 3D snímcích tkání tlustého střeva.
Links
| IAA5004306, research and development project |
| ||
| IBS5004010, research and development project |
| ||
| MSM 143300002, plan (intention) |
|