D 2004

Applications of Image Registration in Human Genome Research

MATULA, Petr, Michal KOZUBEK and Pavel MATULA

Basic information

Original name

Applications of Image Registration in Human Genome Research

Name in Czech

Aplikace registrace obrazů při výzkumu lidského genomu

Authors

MATULA, Petr (203 Czech Republic, guarantor), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic) and Pavel MATULA (203 Czech Republic)

Edition

Berlin, Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, p. 376-384, 9 pp. 2004

Publisher

Springer-Verlag

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

Germany

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14330/04:00009662

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

3-540-22675-3

UT WoS

000224372600032

Keywords in English

image registration; fluorescence microscopy; human genome research

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 7/5/2010 15:35, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Abstract

V originále

Fluorescence microscopy has some limitations and imperfections that can affect some types of study in human genome research. Image registration methods can help overcome or reduce the effect of some of them. This paper is concentrated on several applications of image registration that are carried out in our laboratory. The concerned areas are: 1. chromatic aberration correction, which improves precision of colocalization studies, 2. registration of images after repeated acquisitions, which helps to enlarge the number of object types studied simultaneously, and 3. registration of tilted images in micro-axial tomography, which helps to improve optical resolution of light microscopy.

In Czech

Článek popisuje problémy, které jsou řešeny v naší laboratoři pomocí metod registrace obrazů. Tyto metody pomáhají odstranit nebo potalčit dopady různých nepřesností a omezení fluorescenční mikroskopie, která je používána při výzkumu lidského genomu. Zmíněny jsou tyto oblasti. 1. Korekce barevné vady pro vylepšení kolokalizačních studií. 2. registrace obrazů získaných opakovaným snímáním, což umožňuje sledovat více typů objektů současně. 3. registrace natočených obrazů v mikro-axiální tomografii, což vylepšuje optické rozlišení mikroskopu.

Links

IAA5004306, research and development project
Name: Struktura lidského genomu
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Human genome structure
MSM 143300002, plan (intention)
Name: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Application of computer image analysis in optical microscopy