MATULA, Pavel, Petr MATULA, Michal KOZUBEK and Petr MEJZLÍK. High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis. In 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2004, p. 580-583. ISBN 0-7695-2223-8.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis
Name in Czech Projekt Síťové cytometrie s vysokým rozlišením: Klient/server system pro 3D optickou mikroskopii
Authors MATULA, Pavel (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Petr MATULA (203 Czech Republic, belonging to the institution), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Petr MEJZLÍK (203 Czech Republic).
Edition Los Alamitos, 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, p. 580-583, 4 pp. 2004.
Publisher IEEE Computer Society
Other information
Original language English
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Country of publisher United States of America
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Publication form printed version "print"
RIV identification code RIV/00216224:14330/04:00010341
Organization unit Faculty of Informatics
ISBN 0-7695-2223-8
UT WoS 000224459000076
Keywords in English 3d image processing; high-resolution cytometry
Tags 3d image processing, high-resolution cytometry
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019. Changed: 12/2/2018 15:06.
Abstract
If several laboratories work in the same field and need to cooperate, it is necessary to exchange and mutually compare their computer results. The quick way to solve this problem is to unite their file formats (if it is practicable) or to install new software systems, which are data or file format compatible. A much better solution is to use only one common system. This article describes the architecture of a new client-server system, which offers possibilities of effective cooperation for laboratories doing the research in the field of the spatial organization of human genome. However, the system design is determined mainly by optical microscopy principles and therefore the system can easily be modified for use in other applications or environments. The most pressing problem during the system design was how to share and process large 3D image data in client-server architecture.
Abstract (in Czech)
Pokud pracuje několik laboratoří ve stejném oboru a potřebují spolupracovat, tak si musí nezbytně vyměňovat a vzájemně srovnávat své počítačové výsledky. Rychlý způsob jak vyřešit tento problém je sjednotit souborové formáty nebo nainstalovat takové softwarové systémy, které jsou datově kompatibilní. Lepším řešením je samozřejmě používat pouze jeden společný systém. Článek popisuje architekturu nového klient-server systému, který nabízí možnost efektivní spolupráce laboratoří pracujících na výzkumu v oblasti studia prostorového uspořádání lidského genomu. Návrh systému je však určen především principy optické mikroskopie a je ho proto možné snadno upravit i pro jiné aplikace a prostředí. Nejpalčivějším problémem při návrhu systému bylo jak sdílet a zpracovávat objemná 3D obrazová data v klient-server architektuře.
Links
GP204/03/D034, research and development projectName: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Czech Science Foundation, Threedimensional analysis of cell nuclei using image cytometry
MSM 143300002, plan (intention)Name: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Application of computer image analysis in optical microscopy
PrintDisplayed: 1/8/2024 20:29