Detailed Information on Publication Record
2004
Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
FIALA, Radovan, Markéta MUNZAROVÁ and Vladimír SKLENÁŘBasic information
Original name
Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
Name in Czech
NMR experimenty pro korelaci kvarterních uhlíků v bazích RNA
Authors
FIALA, Radovan (203 Czech Republic, guarantor), Markéta MUNZAROVÁ (203 Czech Republic) and Vladimír SKLENÁŘ (203 Czech Republic)
Edition
1. vyd. Brno, 19th NMR Valtice, p. 33-33, 2004
Publisher
Masarykova univerzita
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
RIV identification code
RIV/00216224:14310/04:00010705
Organization unit
Faculty of Science
ISBN
80-210-3352-5
UT WoS
000222502200002
Keywords in English
NMR; spin-spin coupling; RNA; nucleic acid; quaternary carbon
Změněno: 17/1/2005 12:16, doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
V originále
A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and one selective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.
In Czech
Práce představuje nové heteronukleární 2D NMR experimenty pro korelaci všech kvarterních uhlíků v bázích RNA s jedním nebo více jádry vodíku. Experimenty jsou založeny na jedno, dvou nebo třívazebných interakcích a několikanásobných přenosech magnetizace. Štěpení signálu vlivem jednovazebné interakce uhlík-uhlík je odstraněno pomozí vývoje v konstantním čase nebo selektivní refokusací. Citrlivost navrhovaných experimentů dovoluje naměřit spektra 0.5 mM 25-meru RNA za čtyři hodiny nebo méně. Experimenty jsou aplikovatelné i na vzorky v orietovaných fázích.
Links
| LN00A016, research and development project |
|