D 2004

Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

MATULA, Pavel, Michal KOZUBEK, Stanislav KOZUBEK and Vladan ONDŘEJ

Basic information

Original name

Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits

Name in Czech

Rychlé snímání obrazu živých buněk a jeho limity

Authors

MATULA, Pavel (203 Czech Republic, guarantor), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic), Stanislav KOZUBEK (203 Czech Republic) and Vladan ONDŘEJ (203 Czech Republic)

Edition

Brno, Czech Republic, Biophysics of the Genome, p. 58-61, 4 pp. 2004

Publisher

Masaryk University

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14330/04:00009696

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

80-210-3560-9

Keywords in English

Image analysis

Tags

Tags

International impact
Změněno: 3/6/2010 15:53, doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

Technique of high-resolution cytometry (HRCM) developed in our laboratory is capable of automated (2D as well as 3D) acquisition and analysis of fluorescent stained cells. The cytometer can process large number of cells with high resolution. The acquisition can be repeated in time and that enables live cell studies. If very short events in living cells are studied then the sampling frequency must be high. The highest sampling frequency depends on the technical parameters of the motorized parts of cytometer (especially on the camera frame rate, the speed of filter exchange and the speed of axial movement) and on the control software, which must be appropriately optimized. The limits of the current setup are discussed and available sampling frequencies for different acquisition modes are listed.

In Czech

Technika cytometrie s vysokým rozlišením (HRCM), která byla vyvinuta v naší laboratoři, umožňuje automaticky snímat (2D i 3D) a analyzovat fluorescenčně obarvené buňky. Cytometr je schopen zpracovat velké množství buněk s vysokým rozlišením. Snímání je možné opakovat v čase a to umožňuje provádět studie na živých buňkách. Pokud jsou studovány velmi krátké děje v buňkách tak je nutné zajistit velkou vzorkovací frekvenci. Nejlepší vzorkovací frekvence, které lze dosáhnout, závisí na technických parametrech automatizovaných částí cytometru (zejména snímací rychlosti kamery, rychlosti výměny filtrů a rychlosti axiálního pohybu) a na řídícím software, který musí být náležitě optimaliziván. V článku jsou diskutovány limity současné sestavy a pro různé snímací módy je uveden přehled dostupných vzorkovacích frekvencí.

Links

GA202/04/0907, research and development project
Name: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
Investor: Czech Science Foundation, High-resolution cytometry of living cells
GP204/03/D034, research and development project
Name: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Czech Science Foundation, Threedimensional analysis of cell nuclei using image cytometry
IAA5004306, research and development project
Name: Struktura lidského genomu
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Human genome structure
IBS5004010, research and development project
Name: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Development of new diagnostic teniques for oncology
MSM 143300002, plan (intention)
Name: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Application of computer image analysis in optical microscopy