Image analysis of the movement of sub-cellular structures

MATULA, Petr, Vladan ONDŘEJ a Stanislav KOZUBEK. Image analysis of the movement of sub-cellular structures. In Biophysics of the Genome. First Edition 2004. Brno: Masaryk University, 2004, s. 62-65. ISBN 80-210-3560-9.

Základní údaje

• Originální název: Image analysis of the movement of sub-cellular structures
• Název česky: Obrazová analýza pohybu subcelulárních struktur
• Autoři: MATULA, Petr (203 Česká republika), Vladan ONDŘEJ (203 Česká republika) a Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika, garant).
• Vydání: First Edition 2004. Brno, Biophysics of the Genome, od s. 62-65, 4 s. 2004.
• Nakladatel: Masaryk University

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/04:00009704
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• ISBN: 80-210-3560-9
• Klíčová slova anglicky: image analysiss
• Štítky: image analysiss
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Analysis of time-lapse series of images of living cells requires automation. This contribution concerns the main features of the software package developed for this purpose in our laboratory. Some improvements of our recently published method for tracking of sub-cellular structures based on graph theory are presented. The behaviour of the method is evaluated on images of centromeric heterochromatin defined by HP1beta-GFP fusion protein. The results show that the method is very well applicable for this type of data.

Anotace česky

Analýza časových sérií obrazů živých buněk vyžaduje automatizaci. Tento příspěvek je o hlavních rysech softwarového nástroje, který byl vyvinut pro tento účel v naší laboratoři. Jsou prezentována některá vylepšení dříve publikované metody pro sledování pohybu subcelulárních struktur, která je založena na torii grafů. Chování metody je vyhodnoceno na obrázcích centromerických heterochromatinových oblastí určených HP1beta-GFP proteinem. Výsledky ukazují, že zmíněná metoda je velmi dobře aplikovatelná na tento typ dat.

Návaznosti

• GA202/04/0907, projekt VaV: Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách

• GP204/03/D034, projekt VaV: Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie

• IAA5004306, projekt VaV: Název: Struktura lidského genomu

Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu

• IBS5004010, projekt VaV: Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii

Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii

• MSM 143300002, záměr: Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii