Detailed Information on Publication Record
2004
Nové možnosti v diagnostice kolorektálního karcinomu s využitím technologie cDNA mikročipů
JANSOVÁ, Eva, Petr KRONTORÁD, Zbyněk SVOBODA, Tomáš PAVLÍK, Irena KOUTNÁ et. al.Basic information
Original name
Nové možnosti v diagnostice kolorektálního karcinomu s využitím technologie cDNA mikročipů
Name in Czech
Nové možnosti v diagnostice kolorektálního karcinomu s využitím technologie cDNA mikročipů
Name (in English)
New possibility in colorectal carcinoma diagnosis using cDNA microarrays
Authors
JANSOVÁ, Eva (203 Czech Republic), Petr KRONTORÁD (203 Czech Republic), Zbyněk SVOBODA (203 Czech Republic), Tomáš PAVLÍK (203 Czech Republic), Irena KOUTNÁ (203 Czech Republic), Michal KOZUBEK (203 Czech Republic), Jan ŽALOUDÍK (203 Czech Republic) and Stanislav KOZUBEK (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Klinická onkologie, Brno, ApS Brno, spol.s.r.o. 2004, 0862-495X
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14330/04:00012229
Organization unit
Faculty of Informatics
Keywords in English
cDNA microarray technology; cluster analysis; colorectal cancer; regional metastases
Změněno: 17/1/2005 10:31, Ing. Libor Holuša, CSc.
V originále
Východiska: Technologie DNA mikročipů patří mezi nejmodernější biotechnologie zaznamenávající v posledních letech velký rozvoj. Tato technologie umožňuje porovnání expresních profilů zkoumaných vzorků a je tak vhodná k diagnostice různých onemocnění na genové úrovni. Typ studie a soubor: Cílem této práce bylo porovnat genovou expresi kolorektálního karcinomu s normálním epitelem a detekovat rozdíly v expresi genů mezi pacienty s regionálními metastázemi a bez metastáz. Studie byla provedena na skupině 12 pacientů s kolorektálním karcinomem. Metody a výsledky: Expresní profil pacientů byl studován na 1.7K Human cDNA mikročipech obsahujících 1700 fragmentů lidské cDNA. Mezi kolorektálním karcinomem a zdravým epitelem tlustého střeva bylo nalezeno 22 genů s odlišnou expresí. Pomocí klastrové analýzy byli pacienti rozděleni na 2 skupiny podle výskytu metastáz v lymfatických uzlinách a mezi těmito dvěma skupinami pacientů bylo identifikováno celkem 6 genů se změněnou expresí. Závěr: cDNA microarray technologii bude možné v budoucnu použít jako diagnostický nástroj ke stanovení včasnému a přesnému rozpoznání onemocnění na základě expresního profilu pacienta. Geny vytipované pomocí cDNA mikročipů v našich experimentech mohou být v budoucnu součástí diagnostických mikročipů pro analýzu nádorů tlustého střeva.
In English
Backgrounds: In the last decade various new technologies in medicine and molecular biology have been developed, among others cDNA microarray technology. cDNA microarray technology enables comparison of expression profiles of tested samples and it is convenient for diagnostics of diseases on genes level. Design and Subject: The aim of this study was comparison of gene expression of colorectal carcinoma and colon epithelium and detection of differences in expression profiles of patients with regional metastases and non-metastatic patients. The study was performed on the group of 12 patients with colorectal carcinoma. Methods and Results: 1.7K Human cDNA microarrays containing 1700 fragments of human cDNA were used for determination of expression profiles of patients. We have found 22 genes with altered expression in colorectal carcinoma as compared with normal tissue. Using hierarchical clustering, patients were divided into two groups according to occurrence of regional metastases: patients with regional metastases and non-metastatic patients. These two groups differed in expression of 6 genes. Conclusion: cDNA microarray technology, based on the detection of changes in the expression profiles, provides easier, quicker and more effective diagnostics of various diseases. In future, genes found by cDNA microarrays in our experiments, could constitute a part of the newly developed diagnostics colon cancer chips.
Links
| NC6987, research and development project |
|