Identifikace modifikátorových genů pozdního kvetení u Arabidopsis thaliana

PEŠKA, Vratislav, Pavel LÍZAL, Jana ŘEPKOVÁ and Jiřina RELICHOVÁ. Identifikace modifikátorových genů pozdního kvetení u Arabidopsis thaliana (Identification modifier genes of late-flowering in Arabidopsis thaliana). In IX. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2005, p. 66. ISBN 80-210-3321-5.

Basic information

• Original name: Identifikace modifikátorových genů pozdního kvetení u Arabidopsis thaliana
• Name in Czech: Identifikace modifikátorových genů pozdního kvetení u Arabidopsis thaliana
• Name (in English): Identification modifier genes of late-flowering in Arabidopsis thaliana
• Authors: PEŠKA, Vratislav (203 Czech Republic), Pavel LÍZAL (203 Czech Republic, guarantor), Jana ŘEPKOVÁ (203 Czech Republic) and Jiřina RELICHOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Brno, IX. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 66-66, 2005.
• Publisher: Masarykova univerzita v Brně

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/05:00013640
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 80-210-3321-5
• Keywords in English: modifier genes; late-flowering; Arabidopsis thaliana
• Tags: Arabidopsis thaliana, late-flowering, modifier genes

Abstract

Variabilita v penetranci a expresivitě u monogenně podmíněných znaků může být způsobena vlivem prostředí i genetickými faktory, například modifikátorovými geny. Modifikátorové geny (modifikátory) suprimují, nebo zesilují, účinek cílových (modifikovaných) genů. U člověka a živočišných modelů byla už popsána řada modifikátorů, které pozměňují účinek alel podmiňujících choroby (vrozená hluchota, cystická fibróza, enzymopatie). U rostlin zatím modifikátory popsány nebyly. Přechod z vegetativní fáze do reprodukční fáze je u rostlin klíčový proces. SpiS96 (dominantní mutace Spi indukovaná na genetickém pozadí raně kvetoucí linie S96) oddaluje kvetení a mění tak rostliny raného fenotypu na pozdně kvetoucí. V této práci byla sledována interakce alely SpiS96 a odlišného genetického pozadí raně kvetoucí linie Columbia (Col). V generaci F2 po křížení SpiS96 s raně kvetoucím standardem S96 dochází k jednoduchému štěpení fenotypových tříd v poměru 1 : 3 (rané : pozdní). V generaci F2 po křížení SpiS96 s raně kvetoucí linií odlišného genetického pozadí Columbia je výsledný fenotypový štepný poměr také 1 : 3 (rané : pozdní), avšak u velké části pozdně kvetoucích rostlin je zřetelné další výrazné prodloužení doby do kvetení oproti rodičovské linii. Existence této fenotypové třídy ukazuje na přítomnost modifikátorových genů pro pozdní kvetení u A. thaliana. V generaci F2 tohoto křížení byla proto provedena rekombinační analýza s cílem identifikace lokusů s takovým modifikačním účinkem. Tímto postupem byla zachycena vazba s markerem nga225 na krátkém raménku 5. chromozomu. Nalezený modifikátorový lokus byl předběžně zmapován do pozice 23,6 +/- 5,1 cM od uvedeného markeru.

Abstract (in English)

Variability in penetrance and expressivity Mendelian traits can be caused both environmental and genetic factors. The most referred genetic factors are genetic background and modifier genes. Modifier genes (modifiers) either suppress or enhance effect of target (modified) genes. Modifier genes in many animals as well as in human have been found. These modifiers affect especially loci that cause diseases (e.g. inherited deafness, cystic fibrosis, enzymopathies). Far less we know about modifiers in plants. The transition from vegetative to reproductive stage is a crucial step for development success of plant. SpiS96 mutation (dominant mutation Spi induced in early flowering S96 genetic background) effects late flowering. In this work influence of a different early flowering background Columbia (Col) on SpiS96 phenotype was observed. There was simple ratio 1 : 3 (early : late) observed in F2 progeny after crossing of the late-flowering mutant SpiS96 and early line S96. Similar ratio 1 : 3 (early : late) was observed also after crossing with another early lines (SpiS96 x Columbia), but in this case the group of the late flowering plants was modified - majority of plants flowered much more later than in previous crossing with S96 line. Such extremely late-flowering plants suggest existence of a modifier genes for late-flowering in A. thaliana. Recombination analysis (SpiS96 x Columbia) F2 generation was applied to identification of these modifier loci. By this approach one locus on the top of chromosome 5 was identified (nga225). This possible modifier locus was preliminary mapped to 23,6 +/- 5,1 cM from nga225 marker.

Links

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations