ŠMAJS, David and Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 11-12. ISBN 80-210-3321-5.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins
Name in Czech Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Name (in English) Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins
Authors ŠMAJS, David (203 Czech Republic, guarantor) and Magda JANALÍKOVÁ (203 Czech Republic).
Edition Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. p. 11-12, 2 pp. 2004.
Publisher Masarykova univerzita v Brně
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14110/04:00012096
Organization unit Faculty of Medicine
ISBN 80-210-3321-5
Keywords in English colicin; immunity protein
Tags colicin, immunity protein
Changed by Changed by: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Changed: 30/5/2005 14:05.
Abstract
Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.
Abstract (in English)
Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues V590 a Y586 were found to be important for interaction of colicin Y with its cognate immunity protein and G580 and F576 in the colicin U molecule.
Links
GA310/03/1091, research and development projectName: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
Investor: Czech Science Foundation
PrintDisplayed: 4/5/2024 17:46