Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity
proteins

D 2004

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

ŠMAJS, David and Magda JANALÍKOVÁ

Basic information

Original name

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Name in Czech

Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny

Name (in English)

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Authors

ŠMAJS, David (203 Czech Republic, guarantor) and Magda JANALÍKOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. p. 11-12, 2 pp. 2004

Publisher

Masarykova univerzita v Brně

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/04:00012096

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-210-3321-5

Keywords in English

colicin; immunity protein

Abstract

ORIG EN

V originále

Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.

In English

Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues V590 a Y586 were found to be important for interaction of colicin Y with its cognate immunity protein and G580 and F576 in the colicin U molecule.

Links

GA310/03/1091, research and development project

Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation

Citovat

ŠMAJS, David and Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 11-12. ISBN 80-210-3321-5.

@inproceedings{571689,
   author = {Šmajs, David and Janalíková, Magda},
   address = {Brno},
   booktitle = {VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3321-5},
   pages = {11-12},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins},
   year = {2004}
}

TY  - JOUR
ID  - 571689
AU  - Šmajs, David - Janalíková, Magda
PY  - 2004
TI  - Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021033215
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.
ER  -

ŠMAJS, David and Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In \textit{VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p.~11-12. ISBN~80-210-3321-5.

Detailed Information on Publication Record