Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny

JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny (Hybrid colicin U/Y Molecules and their interactyion with immunity proteins). In Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004. 2004th ed. Brno: Lékařská fakulta MU, 2004, p. 14.

Basic information

• Original name: Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
• Name in Czech: Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
• Name (in English): Hybrid colicin U/Y Molecules and their interactyion with immunity proteins
• Authors: JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: 2004. vyd. Brno, Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004, p. 14-14, 2004.
• Publisher: Lékařská fakulta MU

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/04:00012101
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: colicin; immuinity proteins
• Tags: colicin, immuinity proteins

Abstract

Bylo zkonstruováno 16 hybridních proteinů kolicinů U/Y. Byly nalezeny 3 aminokyselinové zbytky hrající klíčovou roli v interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem a 4 aminokyselinové zbytky důležité pro tutéž interakci u kolicinu Y. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem jsou klíčové aminokyselinové zbytky F576, G580 a L594. Další interakční místo se nachází v pozici 590-592 (L590, A591, V592). Oproti tomu pro interakci kolicinu Y s jeho imunitním proteinem jsou významné jiné aminokyselinové zbytky, a to Y586, V590, A594 a A595. Menší význam v této interakci má i některá z 34 aminokyselin C-konce kolicinu Y (z nichž 12 je rozdílných oproti kolicinu U). Aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y interagující s příslušnými imunitními proteiny jsou lokalizovány do hydrofobní sekvence mezi helixy 8 a 9 kolicinové domény vytvářející kanál v plazmatické membráně.

Abstract (in English)

Sixteen hybrid U/Y proteins were constructed. Three amino acid residues of colicin U and four amino acid residues of colicin Y were found to be important for interaction with cognate immunity proteins. The amino acid residues F576, G580 and L594 were found to be involved in the interaction between colicin U and its immunity protein. Another interaction region is located in the position 590-592. The amino acid residues Y586, V590, A594 and A595 were identified in recognition of colicin Y by its cognate immunity protein. In addition, one of the 34 amino acids in colicin Y C-terminal region (12 amino acids are different when compared to sequence of colicin U) had a slight effect in the recognition of colicin Y with its immunity protein. Important amino acid residues of colicin U and Y interacting with cognate immunity proteins were found to be located in the hydrophobic sequence between helices 8 and 9 in the colicin pore-forming domain.

Links

• GA310/03/1091, research and development project: Name: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Czech Science Foundation