Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{571708,
author = {Strouhal, Michal and Šmajs, David},
address = {Brno},
booktitle = {Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004},
edition = {2004},
keywords = {Treponema pallidu; restriction mapping},
language = {cze},
location = {Brno},
pages = {16 - 17},
publisher = {Lékařská fakulta MU},
title = {Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema},
year = {2004}
}
TY - JOUR
ID - 571708
AU - Strouhal, Michal - Šmajs, David
PY - 2004
TI - Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema
PB - Lékařská fakulta MU
CY - Brno
KW - Treponema pallidu
KW - restriction mapping
N2 - Na základě kompletní sekvence genomu T. pallidum subsp. pallidum (Fraser a kol., 1998) bylo vymezeno 81 oblastí (TPI intervaly) v rámci celého genomu T. pallidum subsp. pallidum a pro každou oblast byla navržena kombinace příslušných primerů. Každý z těchto intervalů byl amplifikován pomocí XL PCR a PCR produkty byly štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III (nebo Spe I, Xba I a Xho I). Takto získaný profil byl použit k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. Heterologní oblasti budou dále sekvenovány a charakterizovány. Velikost amplifikovaných oblastí byla mezi 1778 bp (TPI76) a 27138 bp (TPI62). Doposud byl získán restrikční profil 32 oblastí (33 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. Pouze u jedné z těchto oblastí (TPI48) byl zjištěn rozdíl ve velikosti amplifikovaného PCR produktu u T. paraluiscuniculi oproti zbývajícím treponemálním kmenům. Jedná se o deleci o velikosti přibližně 1 kb. Interval TPI48 je dlouhý 11460 bp a zahrnuje 10 genů (nifS-1, nifU, rpiA, tprI, tprJ, dniR a čtyři kódující oblasti o neznámé funkci). U zbývajících 31 oblastí byl nalezen pouze odlišný restrikční profil. Tyto výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny.
ER -
STROUHAL, Michal and David ŠMAJS. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema (Restriction mapping of closely related spirochetes of the genus Treponema). In \textit{Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004}. 2004th ed. Brno: Lékařská fakulta MU, 2004, p.~16 - 17.
|
