JANALÍKOVÁ, Magda and David ŠMAJS. Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem (Hybrid colicin U/Y molecules and interaction with immunity proteins). In Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003. 2003rd ed. Brno: Lékařská fakulta MU, 2003, p. 15.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
Name in Czech Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem
Name (in English) Hybrid colicin U/Y molecules and interaction with immunity proteins
Authors JANALÍKOVÁ, Magda (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
Edition 2003. vyd. Brno, Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003, p. 15-15, 2003.
Publisher Lékařská fakulta MU
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14110/03:00012111
Organization unit Faculty of Medicine
Keywords in English colicin; immunity protein
Tags colicin, immunity protein
Changed by Changed by: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Changed: 31/5/2005 10:38.
Abstract
V nedávné době byly popsány a molekulárně charakterizovány dva nové koliciny U a Y. Plazmid pColU, který byl identifikován v bakterii Shigella boydii, nese skupinu genů zahrnující gen pro kolicin U, gen pro imunitní protein a gen pro lytický protein. Plazmid pCol-Let, který byl izolován z bakterie E. coli, nese podobnou skupinu genů pro kolicin Y a geny pro imunitní a lytické proteiny. Příbuznost těchto kolicinů je založena na sekvenční podobnosti kolicinů, imunitních proteinů a proteinů lytických. Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y, nejsou producenti obou kolicinů zkříženě imunní. Jednou z možností studia interakce kolicinu s imunitním proteinem je zkoumání letálního účinku hybridních či mutovaných kolicinů (jejichž producenti nejsou zkříženě imunní) na buňky transformované plazmidem nesoucím imunitní protein. Zkonstruovali jsme pět hybridních proteinů kolicinu U/Y a zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu U kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa (34 aminokyselin od C-konce z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách. Navíc jsou připravovány hybridní molekuly imunitních proteinů U/Y, které budou použity pro studium oblastí imunitních proteinů interagujících s koliciny U a Y.
Abstract (in English)
Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues important for recognition of colicin molecule were found for colicin Y and for colicin U.
Links
GA310/03/1091, research and development projectName: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
Investor: Czech Science Foundation
PrintDisplayed: 19/7/2024 09:20