D 2005

Biotypizace a ribotypizace kmenů Aeromonas hydrophila komplexu

NOVÁKOVÁ, Dana, Anna ANDĚLOVÁ, Eva KREJČÍ, Ivo SEDLÁČEK, Iva PORAZILOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Biotypizace a ribotypizace kmenů Aeromonas hydrophila komplexu

Name (in English)

Biotyping and ribotyping of strains from Aeromonas hydrophila complex

Authors

NOVÁKOVÁ, Dana (203 Czech Republic, guarantor), Anna ANDĚLOVÁ (203 Czech Republic), Eva KREJČÍ (203 Czech Republic), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic) and Iva PORAZILOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Bratislava, I. diskusné fórum klinickej mikrobiológie, p. 10-11, 2 pp. 2005

Publisher

Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00013809

Organization unit

Faculty of Science

ISSN

Keywords in English

Biotyping; Ribotyping; Identification; Aeromonas
Změněno: 3/2/2010 14:53, prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.

Abstract

V originále

Aeromonády patří mezi gramnegativní fermentující oxidáza pozitivní bakterie, které se vyskytují běžně ve vodních ekosystémech tropů, subtropů i mírného pásma. Tyto vodou přenosné organismy mohou však u hostitele způsobovat také gastroenteritidy, ale také ranné infekce či vzácně závažné septické stavy. Nejčastějšími patogenními aeromonádami člověka jsou A. hydrophila subsp. hydrophila, A. caviae a A. sobria. Ve vodním prostředí se pak kromě zmiňovaných vyskytují A. bestiarum. A. salmonicida, A. media a další. Biochemické vlastnosti skupiny 15 kmenů získaných z klinického materiálu a z vodního prostředí byly testovány komerční soupravou ENTEROtest24 (Pliva-Lachema) a dodatkovými testy. Charakterizace kmenů byla rozšířena ribotypizací izolátů a referenčních kmenů provedenou pomocí EcoRI restrikčního enzymu a značené sondy komplementární k 16S a 23S rRNA. Pomocí biotypizace byly všechny testované kmeny identifikovány jako zástupci A. hydrophila komplexu. Izoláty se shodovaly ve všech testech klíčových pro A. hydrophila komplex a to bez ohledu na zdroj izolátů. Ribotypizace umožnila zařazení všech klinických izolátů až do poddruhu A. hydrophila subsp. hydrophila. Vodní izoláty náleží do samostatné, od ostatních kmenů dobře oddělené skupiny. Jeden kmen této skupiny vykazuje velkou podobnost ribotypu s typovou kulturou A. bestiarum, zatímco ostatní kmeny nebylo možné na základě podobnosti ribotypů klasifikovat. Z výsledků vyplývá, že ačkoliv byly všechny kmeny na základě shodných biochemických vlastností zařazeny do A. hydrophila komplexu, ribotypizace odhalila zásadní rozdíly v profilu ribotypů izolátů z klinického materiálu a z vodního prostředí. Testované izoláty z vod pravděpodobně představují nový taxon s výjimkou jednoho A. bestiarum kmene. Ribotypizace narozdíl od biotypizace klasifikovala klinické izoláty až do poddruhu a jeví se být vhodnou metodou pro studium aeromonád. Přestože je práce založená na malé skupině kmenů potvrzuje se, že A. hydrophila subsp. hydrophila je jedním z nejčetněji zastoupených druhů aeromonád v klinickém materiálu a že vodní ekosystém je v zastoupení aeromonád druhově rozmanitější.

In English

A group of 22 strains of Aeromonas hydrophila complex were identified by biotyping a ribotyping. Strains were identified as A. hydrophila complex based on biotyping while ribotyping showed different cluster for stains isolated from clinical material a different one for strains from aquatic environment.The clinical isolates were assinged to the subspecies level, Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila by ribotyping. The results confirme benefit of ribotyping in studying and identification of aeromonads.

Links

MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time