J 2005

Staphylococcus simiae sp. nov., isolated from South American squirrel monkeys

PANTŮČEK, Roman, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Dagmar KOUKALOVÁ, Pavel ŠVEC et. al.

Basic information

Original name

Staphylococcus simiae sp. nov., isolated from South American squirrel monkeys

Name in Czech

Staphylococcus simiae sp. nov., nový druh izolovaný z kotula veverovitého

Authors

PANTŮČEK, Roman (203 Czech Republic, guarantor), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic), Petr PETRÁŠ (203 Czech Republic), Dagmar KOUKALOVÁ (203 Czech Republic), Pavel ŠVEC (203 Czech Republic), Vlastimil ŠTĚTINA (203 Czech Republic), Marc VANCANNEYT (56 Belgium), Lenka CHRASTINOVÁ (203 Czech Republic), Jitka VOKURKOVÁ (203 Czech Republic), Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Czech Republic), Jiří DOŠKAŘ (203 Czech Republic), Jean SWINGS (56 Belgium) and Václav HÁJEK (203 Czech Republic)

Edition

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Reading, United Kingdom, Society for General Microbiology, 2005, 1466-5026

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 2.744

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00012536

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000232239600035

Keywords in English

Staphylococcus simiae sp. nov.; taxonomy; non-human primates; New World Monkeys; Staphylococcus aureus; Staphylococcus piscifermentans

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 1/7/2009 18:38, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Abstract

V originále

Eight coagulase-negative, oxidase-negative and novobiocin-susceptible staphylococcal strains were isolated from the gastrointestinal tract of South American squirrel monkeys (Saimiri sciureus L.). These strains were differentiated from known staphylococcal species on the basis of 16S rRNA gene and hsp60 gene sequencing, and from the most closely related species using DNA-DNA hybridization, ribotyping, whole cell protein profiles and biotyping. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence confirmed that these strains are members of the Staphylococcus aureus species group (99 % similarity) but are similar in biochemical characteristics to Staphylococcus piscifermentans from which they can be phenotypically distinguished by resistance to polymyxin B, acid production from D-mannitol, negative hydrolysis of esculin and DNA, and negative production of beta-glucosidase. Based on the results, a novel species of the genus Staphylococcus is described, for which the name Staphylococcus simiae sp. nov. is proposed. The type strain has been deposited in the Czech Collection of Microorganisms under accession number CCM 7213T (= LMG 22723T).

In Czech

Autoři informují o novém druhu Staphylococcus simiae, který byl opakovaně izolován z rektálních výtěrů opic čeledi malpovitých v letech 2000-2005. Izoláty pocházely ze zdravých kotulů s výjimkou jednoho případu, u něhož byly pozorovány průjmy, krvácení z konečníku a posléze exitus. Popisovány jsou morfologické, fyziologické a biochemické charakteristiky nového taxonu, včetně jeho citlivosti k antimikrobním látkám a genetických vlastností. Fenotypové odlišení Staphylococcus simiae od příbuzných druhů, především Staphylococcus piscifermentans, je možné na základě jeho neschopnosti hydrolyzovat eskulin a DNA, produkovat alfa a beta glukosidasu, dále tvoří kyselinu z D-mannitolu a je rezistentní k polymyxinu B. Genetické vlastnosti vymezující nový druh spočívají v 72 % odlišnosti od fylogeneticky příbuzných druhů na základě DNA-DNA hybridizace, ribotypizace prokázala podobnost s ostatními druhy rodu Staphylococcus nižší než 62 %. Na základě fylogenetické analýzy založené na porovnání sekvencí genů kódujících 16S ribozomální RNA je nový druh blízce příbuzný druhu Staphylococcus aureus. Obsah G + C u typového kmene CCM 7213T = LMG 22723T je 33.8 mol%.

Links

GA301/02/1505, research and development project
Name: Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků
Investor: Czech Science Foundation, Molecular diagnostic, epidemiology and classification of pathogenic Gram positive cocci
GP204/02/D099, research and development project
Name: Knihovna ribotypizačních profilů typových kultur bakterií
Investor: Czech Science Foundation, Database of the ribotype profiles of bacterial type strains
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time