Detailed Information on Publication Record
2005
Analysis of biomedical image data acquired using optical microscopy
KOZUBEK, Michal, Pavel MATULA, Petr MATULA and David SVOBODABasic information
Original name
Analysis of biomedical image data acquired using optical microscopy
Name in Czech
Analýza biomedicínských dat pořízených na optickém mikroskopu
Authors
KOZUBEK, Michal (203 Czech Republic, guarantor), Pavel MATULA (203 Czech Republic), Petr MATULA (203 Czech Republic) and David SVOBODA (203 Czech Republic)
Edition
Prague, Czech Republic, Prague Post Genome Technology Workshop, p. 24-27, 4 pp. 2005
Publisher
Czech Pattern Recognition Society
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14330/05:00012538
Organization unit
Faculty of Informatics
ISBN
80-01-03239-6
Keywords in English
optical microscope; image analysis; image reconstruction; image registration
Tags
International impact, Reviewed
Změněno: 7/5/2010 09:11, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.
V originále
Our laboratory specialized in the analysis of biomedical images acquired using optical microscopes (Laboratory of Optical Microscopy - LOM) has been gradually evolving since 1997. It is a highly professional interdisciplinary workplace, where experts in informatics, mathematics, physics, molecular biology, and medicine successfully collaborate. The laboratory is equipped both for the biomedical material preparation for microscopy (especially cell component staining with fluorescent dyes) and for automated optical microscopy. Concerning automated microscopy, it is equipped with Zeiss Axiovert inverted fluorescence microscope with CARV confocal unit, motorized components for the x, y, z stage movement and the optical filter change, a special camera for fluorescence microscopy (Roper Scientific) and a control two-processor computer. A unique device for automated micro-axial tomography, developed in collaboration with colleagues from Heidelberg, is also available. Overnight acquisition and image analysis is possible in automated mode. The equipment described above is unique in the world and patented in the Czech Republic. It allows processing of a considerably higher and statistically more significant amount of cell material than other systems in other laboratories.
In Czech
Laboratoř optické mikroskopie (LOM), která je zaměřená na analýzu biomedicínských dat získaných z optického mikroskopu, se vyvíjí již od roku 1997. Je to prostředí, v němž se setkávají a úzce spolupracují lidé z různých vědních oborů jako informatika, matematika, fyzika, molekulární biologie a lékařství. Laboratoř je vybavena jak pro přípravu biomedicínských vzorků, tak rovněž nabízí možnost automatizovaného snímání. Součástí technického vybavení je také unikátní zařízení pro mikroaxiální tomografii, které bylo vyvinuto ve spolupráci s partnerským pracovištěm v Heidelbergu (Německo). Technické prostředky laboratoře umožňují zpracování výrazně většího množství buněčného materiálu než jiné systémy provozované v jiných laboratořích.
Links
GA202/04/0907, research and development project |
| ||
IAA5004306, research and development project |
| ||
MSM0021622419, plan (intention) |
|