Detailed Information on Publication Record
2004
Parallelization of the Programme CICADA
KOSINA, Aleš, Martin ČERNOHORSKÝ and Zdeněk KŘÍŽBasic information
Original name
Parallelization of the Programme CICADA
Name in Czech
Paralelizace programu CICADA
Authors
KOSINA, Aleš (203 Czech Republic, guarantor), Martin ČERNOHORSKÝ (203 Czech Republic) and Zdeněk KŘÍŽ (203 Czech Republic)
Edition
Praha, 14th Summer School on Computing Techuniques in Physics: Cluster for Computing in Physics, p. 26-28, 2004
Publisher
Fyzikální ústav AVČR
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/04:00021378
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
Parallelization; Single Coordinate Driving; Conformational Analysis; Grid
Změněno: 22/2/2006 14:14, Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
V originále
CICADA programme is based on SCD (Single Coordinate Driving) approach and is used for comformational analysis and molecular docing of small and middle sized molecules. CICADA programme was parallelized in Master-Slave approach. Results shows very good scalability even on small molecules with few rotable bonds. Programme can solve larger problems than its sequential predecessor.
In Czech
Program CICADA je postaven na SCD (Single Coordinate Driving) přístupu a je používán pro konformační analýzu malých a středních molekula a pro molekulární docking. Program CICADA byl paralelizován pomocí Master-Slave přístupu. Výsledky ukazují velmi dobrou škálovatelnost i na malých molekulách a několika málo rotovatelnými torzemi. Program může řešit ulohy většího rozsahu než dokázala sekvenční verze.
Links
| MSM 143100005, plan (intention) |
|