D 2005

A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data

BUDINSKÁ, Eva and Eva GELNAROVÁ

Basic information

Original name

A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data

Name in Czech

Metoda detekce bodů zlomu u array CGH dat

Authors

BUDINSKÁ, Eva and Eva GELNAROVÁ

Edition

Brno, EnviroInfo Brno 2005. Networking Environmental Information. Part 2. Proceedings of the 19th International Conference Informatics for Environmental Protection. p. 673 - 676, 4 pp. 2005

Publisher

Masaryk University in Brno

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10103 Statistics and probability

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-210-3780-6

Keywords in English

array CGH; breakpoint detection; analysis; microarray

Tags

analysis, array CGH, breakpoint detection, microarray
Změněno: 28/4/2006 19:26, RNDr. Eva Gelnarová

Abstract

ORIG CZ

V originále

In present, microarray CGH experiments became a powerful technique for analysing changes in DNA, by comparing control DNA and DNA of interest. This is widely used for example in genome cancer or species distin-guishing studies. The method produce huge amount of data and special statistic techniques for detecting copy number changes regions are necessary. We propose a new method for detecting breakpoints in DNA. The performance of the method is demonstrated using publicly available data set.

In Czech

V současné době se microarray CGH experimenty stávají stále více využívanou technologií pro analýzu změn v DNA, a to porovnáváním kontrolní a studované DNA. Výsledkem metody je značné množství dat, kterých analýza (detekce změnených regionů) vyžaduje speciální statistické techniky. V tomto příspěvku navrhujeme novou metodu pro detekci bodů zlomu v DNA. Výsledky metody demonstrujeme na veřejně přístupném datasetu.

Links

1ET208120511, research and development project
Name: Implementace a validace robustního znalostního analytického systému UIRON pro oblast onkologie
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Implementation and validation of robust knowledge management and analytical system UIRON for oncology
Displayed: 13/11/2024 08:18