Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

D 2005

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK

Basic information

Original name

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

Name in Czech

Úvod do analýzy a designu DNA microarrays

Name (in English)

Introduction into study design and data analysis of DNA microarrays

Authors

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK

Edition

Brno, Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. p. 99-100, 2 pp. 2005

Publisher

Česká společnosti pro analytickou cytologii

Other information

Language

Slovak

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-239-5155-6

Keywords in English

microarrays; design; analysis

Abstract

ORIG CZ EN

V originále

Technika microarrays je v dnešnej dobe jednou z najperspektívnejších metód využívaných pre analýzu genómu. Microarray technológia dovoľuje súčasnú analýzu tisícov parametrov v rámci jedného experimentu. Na základe predmetu skúmania sa dajú microarrays zjednodušene rozdeliť na: 1. CGH microarrays - pomocou microarray technológie sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou technikou je Komparatívna genómová hybridizácia (CGH). 2. Expresné microarrays - sleduje sa úroveň expresie jednotlivých génov na úrovni mRNA. 3. Proteínové microarrays jedno z najnovších využití microarray technológie, sledujú sa zmeny na úrovni proteínov. Analýza proteínových microarrays je odlišná technológiou i následnou analýzou. Na základe toho aký cieľ sme experimentu vytýčili sa stanovuje jeho celkový design. Do celkového designu experimentu patrí ako odhad počtu potrebných microarray čipov a pacientov tak aj výber vhodného microarray designu (loop, referenčný, balancovaný).

In Czech

Neznámý popis výsledku

In English

Unknown description

Links

1ET208120511, research and development project

Name: Implementace a validace robustního znalostního analytického systému UIRON pro oblast onkologie

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Implementation and validation of robust knowledge management and analytical system UIRON for oncology

Citovat

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK. Úvod do analýzy a designu DNA microarrays (Introduction into study design and data analysis of DNA microarrays). In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, p. 99-100. ISBN 80-239-5155-6.

@inproceedings{584101,
   author = {Budinská, Eva and Jarkovský, Jiří and Dušek, Ladislav},
   address = {Brno},
   booktitle = {Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.},
   keywords = {microarrays; design; analysis},
   language = {sla},
   location = {Brno},
   isbn = {80-239-5155-6},
   pages = {99-100},
   publisher = {Česká společnosti pro analytickou cytologii},
   title = {Úvod do analýzy a designu DNA microarrays},
   year = {2005}
}

TY  - JOUR
ID  - 584101
AU  - Budinská, Eva - Jarkovský, Jiří - Dušek, Ladislav
PY  - 2005
TI  - Úvod do analýzy a designu DNA microarrays
PB  - Česká společnosti pro analytickou cytologii
CY  - Brno
SN  - 8023951556
KW  - microarrays
KW  - design
KW  - analysis
N2  - Technika microarrays je v dnešnej dobe jednou z najperspektívnejších metód využívaných pre analýzu genómu. Microarray technológia dovoľuje súčasnú analýzu tisícov parametrov v rámci jedného experimentu. Na základe predmetu skúmania sa dajú microarrays zjednodušene rozdeliť na: 1. CGH microarrays - pomocou microarray technológie sa odhaľujú zmeny v počte kópií génov alebo chromozómov (tzv. copy number changes), teda sa analyzuje priamo DNA. Základnou technikou je Komparatívna genómová hybridizácia (CGH). 2. Expresné microarrays - sleduje sa úroveň expresie jednotlivých génov na úrovni mRNA. 3. Proteínové microarrays jedno z najnovších využití microarray technológie, sledujú sa zmeny na úrovni proteínov. Analýza proteínových microarrays je odlišná technológiou i následnou analýzou. Na základe toho aký cieľ sme experimentu vytýčili sa stanovuje jeho celkový design. Do celkového designu experimentu patrí ako odhad počtu potrebných microarray čipov a pacientov tak aj výber vhodného microarray designu (loop, referenčný, balancovaný).
ER  -

BUDINSKÁ, Eva, Jiří JARKOVSKÝ and Ladislav DUŠEK. Úvod do analýzy a designu DNA microarrays (Introduction into study design and data analysis of DNA microarrays). In \textit{Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III.}. Brno: Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005, p.~99-100. ISBN~80-239-5155-6.

Detailed Information on Publication Record