Identifikace neznámých spirochét v DFM pozitivních vzorcích

NOREK, Adam, Alena ŽÁKOVSKÁ and Miloš DENDIS. Identifikace neznámých spirochét v DFM pozitivních vzorcích (Identification of spirochetes in DFM positive samples). In Tomáškovy dny 2005 sborník abstraktů. 2005.

Basic information

• Original name: Identifikace neznámých spirochét v DFM pozitivních vzorcích
• Name (in English): Identification of spirochetes in DFM positive samples
• Authors: NOREK, Adam (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Alena ŽÁKOVSKÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Miloš DENDIS (203 Czech Republic).
• Edition: Tomáškovy dny 2005 sborník abstraktů, 2005.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/05:00025524
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: DFM; PCR; PCR-RFLP; Borrelia burgdorferi sensu lato; 16S rRNA
• Tags: 16S rRNA, Borrelia burgdorferi sensu lato, DFM, PCR, PCR-RFLP
• Tags: Reviewed

Abstract

Během výzkumu běžných i potenciálních přenašečů spirochét rodu Borrelia burgdorferi sensu lato, jsme narazili na rozpor při srovnání výsledků vyšetřovaných vzorků metodami PCR a DFM. Tento rozdíl činí DFM/PCR u vývojových stadií Ixodes ricinus 27,6 %, u dospělců Culex (culex) pipiens pipiens 79 % a u larev tohoto komára 62 %. To nás vede k domněnce, že se u těchto členovců mohou vykytovat, třeba jen dočasně i jiné druhy spirochét. K potvrzení či vyvrácení této domněnky, se snažíme identifikovat sporné vzorky kombinací metod PCR, PCR-RFLP a sekvenační analýzy DNA. U DFM pozitivních izolátů určíme rod popřípadě druh spirochéty pomocí PCR genu pro 16S rRNA a RFLP. Vzorky, které neodpovídají Borrelia burgdorferi s. s., se pak identifikují sekvenační analýzou.

Abstract (in English)

During our researches of common and potential vectors of spirochetes Borrelia burgdorferi sensu lato, we have found out the disagreement in results obtained by PCR and DFM. This difference (DFM/PCR) was in case of developmental stages of Ixodes ricinus 27.6 %, adult Culex pipiens pipiens 79 % and Culex pipien pipiens larvae 62 %. These results make us to consider the possibility of occurrence, even temporally, of other spirochetes. To confirm or disprove this assumption we have tried to type our specimens, using combination of PCR, PCR-RFLP and sequenation.

Links

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations