a 2005

Identifikace neznámých spirochét v DFM pozitivních vzorcích

NOREK, Adam, Alena ŽÁKOVSKÁ and Miloš DENDIS

Basic information

Original name

Identifikace neznámých spirochét v DFM pozitivních vzorcích

Name (in English)

Identification of spirochetes in DFM positive samples

Authors

NOREK, Adam (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Alena ŽÁKOVSKÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Miloš DENDIS (203 Czech Republic)

Edition

Tomáškovy dny 2005 sborník abstraktů, 2005

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00025524

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

DFM; PCR; PCR-RFLP; Borrelia burgdorferi sensu lato; 16S rRNA

Tags

Reviewed
Změněno: 12/1/2012 20:56, doc. RNDr. Alena Žákovská, Ph.D.

Abstract

V originále

Během výzkumu běžných i potenciálních přenašečů spirochét rodu Borrelia burgdorferi sensu lato, jsme narazili na rozpor při srovnání výsledků vyšetřovaných vzorků metodami PCR a DFM. Tento rozdíl činí DFM/PCR u vývojových stadií Ixodes ricinus 27,6 %, u dospělců Culex (culex) pipiens pipiens 79 % a u larev tohoto komára 62 %. To nás vede k domněnce, že se u těchto členovců mohou vykytovat, třeba jen dočasně i jiné druhy spirochét. K potvrzení či vyvrácení této domněnky, se snažíme identifikovat sporné vzorky kombinací metod PCR, PCR-RFLP a sekvenační analýzy DNA. U DFM pozitivních izolátů určíme rod popřípadě druh spirochéty pomocí PCR genu pro 16S rRNA a RFLP. Vzorky, které neodpovídají Borrelia burgdorferi s. s., se pak identifikují sekvenační analýzou.

In English

During our researches of common and potential vectors of spirochetes Borrelia burgdorferi sensu lato, we have found out the disagreement in results obtained by PCR and DFM. This difference (DFM/PCR) was in case of developmental stages of Ixodes ricinus 27.6 %, adult Culex pipiens pipiens 79 % and Culex pipien pipiens larvae 62 %. These results make us to consider the possibility of occurrence, even temporally, of other spirochetes. To confirm or disprove this assumption we have tried to type our specimens, using combination of PCR, PCR-RFLP and sequenation.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations