D 2005

Identification of human Bifidobacterium strains using genus and species specific PCR

RITTICH, Bohuslav, Alena ŠPANOVÁ and Vladimír DRÁB

Basic information

Original name

Identification of human Bifidobacterium strains using genus and species specific PCR

Name in Czech

Identifikace lidských kmenů bifidobakterií pomocí rodově a druhově specifické PCR

Authors

RITTICH, Bohuslav (203 Czech Republic, guarantor), Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic) and Vladimír DRÁB (203 Czech Republic)

Edition

Egmond aan Zee, the Netherlands, 8th Symposium on Lactic Acid Bacteria, p. B050-B050, 1 pp. 2005

Publisher

FEMS, The Netherlands Society for Microbiology

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Netherlands

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/05:00014198

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

Bifidobacterium human strains; PCR; ARDRA; fermentation profiles
Změněno: 1/3/2006 15:13, doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Abstract

V originále

In the present study genus-specific and species-specific PCR primers were used to identify Bifidobacterium strains isolated from infant faecal samples. Bifidobacteria were differentiated at the species level by a restriction using the enzymes BamHI, Sau3AI, and TaqI (amplified ribosomal DNA restriction analysis ARDRA). Altogether 60 strains of Bifidobacteria identified in the collected infant faeces were analysed. Selected bifidobacteria were also differentiated using REP-PCR and RAPD analysis. Fermentation profiles and some technological characteristics of selected bacterial strains, as a surviving at low pH, resistance to bile salts, and the influence of isolated strains on the growth of selected starter cultures were also studied.

In Czech

Rodově a druhově specifická PCR byla použita k identifikaci kmenů rodu Bifidobacterium, které byly izolovány z dětských fekálních vzorků. Bifidobakterie byly rozlišeny na druhy pomocí restriknční analýzy s využitím enzymů BamHI, Sau3AI a TaqI (ARDRA). Celkem bylo analyzováno 60 vzorků. Vybrané bifidobakterie byly rozlišeny i pomocí REP-PCR a RAPD. U vybraných kmenů byly rovněž stanoveny fermentační profily a některé technologické vlastnosti (přežívání při nízkém pH, rezistence k žlučovým solím, vliv na růst vybraných startovacích kultur).

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
QF3169, research and development project
Name: Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů baktérií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin
Investor: Ministry of Agriculture of the CR, The use of procedures on basis of molecular genetics in acquiring of new bacterial strains with probiotic properties with the aim to increase specific genetic sources for production of functional foods